RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001172.11

Ankrd39-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 2,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa22.95■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Scn7aB1AYL1 1681 aa22.95■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dbr1Q923B1 550 aa22.94■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Stk31Q99MW1 1018 aa22.94■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 FancaQ9JL70 1439 aa22.94■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gnai1B2RSH2 354 aa22.94■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.94■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Iqcf3Q9D498 203 aa22.94■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gnai3Q9DC51 354 aa22.94■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa22.93■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa22.93■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cabp4Q8VHC5 271 aa22.93■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rlbp1Q9Z275 317 aa22.92■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Col14a1Q80X19 1797 aa22.92■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Vamp4O70480 141 aa22.9■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc35g1Q8BY79 368 aa22.9■■□□□ 1.26
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa22.89■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm6268A2A3U9 297 aa22.88■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Parp14Q2EMV9 1817 aa22.88■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmem2Q5FWI3 1383 aa22.87■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.87■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zfp777B9EKF4 885 aa22.86■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa22.86■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Usp16Q99LG0 825 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PtprvP70289 1705 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rad17Q6NXW6 688 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slit2Q9R1B9 1521 aa22.84■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Eya1P97767 591 aa22.84■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nsd3Q6P2L6 1439 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Znf330Q922H9 316 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sos1Q62245 1319 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ano8Q6PB70 1060 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Klhdc4Q921I2 584 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Hoxc9P09633 260 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nectin2P32507 530 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmco5bQ80X59 307 aa22.81■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ccne1Q61457 408 aa22.81■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ipo9Q91YE6 1041 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Q3UPC7 1272 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ptpn23Q6PB44 1692 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Armcx1Q9CX83 456 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nutm1Q8BHP2 1126 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ncoa4Q5U4H9 625 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tet3Q8BG87 1668 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fyb1O35601 819 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmem132eQ6IEE6 982 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slain2Q8CI08 581 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Wdr17E9Q271 1322 aa22.74■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gimap6Q8K349 305 aa22.73■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 TimelessQ9R1X4 1197 aa22.73■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Trpm3Q5F4S9 1721 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Atl3Q91YH5 541 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nfat5Q9WV30 1534 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 MvpQ9EQK5 861 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Robo1O89026 1612 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ggnbp2Q5SV77 696 aa22.7■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa22.7■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cluap1Q8R3P7 413 aa22.7■■□□□ 1.23
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Snap23O09044 210 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Hs1bp3Q3TC93 395 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 AU019823E9PUQ3 292 aa22.69■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Prim1P20664 417 aa22.69■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ankrd44B2RXR6 993 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 TatQ8QZR1 454 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 HypkQ9CR41 129 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Evi5lH3BKQ3 813 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Chl1P70232 1209 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kcnh5Q920E3 988 aa22.66■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa22.65■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Trim30dE9PWL0 497 aa22.65■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.65■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pibf1E9Q6K3 756 aa22.64■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ric3Q8BPM6 367 aa22.64■■□□□ 1.22
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kcna6Q61923 529 aa22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dnajc10Q9DC23 793 aa22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kif24Q6NWW5 1356 aa22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Arfgef2A2A5R2 1792 aa22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Col18a1P39061 1774 aa22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.4 ms