RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CFAP58Q5T655 872 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ANO7Q6IWH7 933 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 LINC00523Q86TU6 105 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HOOK3Q86VS8 718 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 RASSF3Q86WH2 238 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 IFT20Q8IY31 132 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 STK40Q8N2I9 435 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CHST14Q8NCH0 376 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HMGB4Q8WW32 186 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 SEC14L1Q92503 715 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CPT1BQ92523 772 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 RUBCNQ92622 972 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 NELL1Q92832 810 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 TADA1Q96BN2 335 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 IFT43Q96FT9 208 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HINFPQ9BQA5 517 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 KCNH6Q9H252 994 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 FBRSQ9HAH7 460 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 WHRNQ9P202 907 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 A0A1W2PQ67 120 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 AP3B1O00203 1094 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 AXIN1O15169 862 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PRPF8-210ENST00000574217 LEFTY1O75610 366 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ALDH1A2O94788 518 aa6.75□□□□□ -1.33
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PRPF8-210ENST00000574217 SUN1O94901 812 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 PGLSO95336 258 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 NDST3O95803 873 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ADH1BP00325 375 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 IL1BP01584 269 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 EPOP01588 193 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 UGT2B4P06133 528 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CTSLP07711 333 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 NDUFV2P19404 249 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HLA-DPA1P20036 260 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HOXA6P31267 233 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 COPAP53621 1224 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ITGA8P53708 1063 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 PLTPP55058 493 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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PRPF8-210ENST00000574217 CDK18Q07002 472 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 TRAF2Q12933 501 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CUL1Q13616 776 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 SPARCL1Q14515 664 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 IHHQ14623 411 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ARSIQ5FYB1 569 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 KCTD11Q693B1 232 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 KDELC1Q6UW63 502 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 LONP2Q86WA8 852 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF8-210ENST00000574217 CACUL1Q86Y37 369 aa6.75□□□□□ -1.33
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