RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 SUV39H1O43463 412 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SEMA3DO95025 777 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MLH1P40692 756 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NME5P56597 212 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PTSQ03393 145 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 VSTM1Q6UX27 236 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DEFB106AQ8N104 65 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ART4Q93070 314 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SENP8Q96LD8 212 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SNPHO15079 494 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFS2O75306 463 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CLDN11O75508 207 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 AAGABQ6PD74 315 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ALG9Q9H6U8 611 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HPS4Q9NQG7 708 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC182A6NF36 153 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LAPTM5Q13571 262 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SEPHS2Q99611 448 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 EXD2Q9NVH0 621 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ATG13O75143 517 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 KLRK1P26718 216 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 FMO4P31512 558 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MON1AQ86VX9 555 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LEMD2Q8NC56 503 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 EDEM1Q92611 657 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 UGT2B11O75310 529 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CSNK2BP67870 215 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CXCL9Q07325 125 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ACVR2BQ13705 512 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BMPR2Q13873 1038 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 C11orf74Q86VG3 221 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SNX32Q86XE0 403 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TCF12Q99081 682 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 C5orf60A6NFR6 353 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A12O75746 678 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TPSB2P20231 275 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NR1D2Q14995 579 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TPSAB1Q15661 275 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RGS21Q2M5E4 152 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ING3Q9NXR8 418 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 COMMD9Q9P000 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA2Q9UM82 520 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DCXO43602 365 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ACSL4O60488 711 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RPS6KA3P51812 740 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RAB2AP61019 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ADSSP30520 456 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms