RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464408.3

ALMS1-202, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 5

Gene ALMS1, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-202ENST00000464408 CKMT1AP12532 417 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 ETFBP38117 255 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 OGDHQ02218 1023 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 UBXN1Q04323 297 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 RTP5Q14D33 572 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 PLPP6Q8IY26 295 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 HMCESQ96FZ2 354 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 MCEEQ96PE7 176 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 AGPAT1Q99943 283 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.72□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 LRP4O75096 1905 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 NEMP1O14524 444 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 AREL1O15033 823 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 SCAMP1O15126 338 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 TSPAN6O43657 245 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 CREB3O43889 395 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 OPA1O60313 960 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 MMP20O60882 483 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 CSF2P04141 144 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 EPHB2P29323 1055 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 IGFALSP35858 605 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 ABCG1P45844 678 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 MYL5Q02045 173 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 SGCGQ13326 291 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 NCAPHQ15003 741 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 VPS36Q86VN1 386 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 PARGQ86W56 976 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 RBFAQ8N0V3 343 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 EXOC2Q96KP1 924 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 LHX3Q9UBR4 397 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 FZD10Q9ULW2 581 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.71□□□□□ -0.05
ALMS1-202ENST00000464408 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 RASA4BC9J798 803 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 FPGTO14772 594 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 RASA4O43374 803 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 PIGNO95427 931 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 ATP1A3P13637 1013 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 RABIFP47224 123 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 PFN3P60673 137 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 E2F1Q01094 437 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 HS1BP3Q53T59 392 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 RAB7BQ96AH8 199 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 CENPTQ96BT3 561 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 IFT43Q96FT9 208 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 MGAQ8IWI9 3026 aa14.7□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 AQP9O43315 295 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 GCATO75600 419 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 MPOP05164 745 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 ALPPL2P10696 532 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 TIMP2P16035 220 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 JUNDP17535 347 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 RHOAP61586 193 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 SERINC3Q13530 473 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 C1orf61Q13536 156 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 CYTH1Q15438 398 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 STX1AQ16623 288 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 CDKN3Q16667 212 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 CA9Q16790 459 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 EFHC2Q5JST6 749 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 GUSBP11Q6P575 273 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.69□□□□□ -0.06
ALMS1-202ENST00000464408 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms