RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053729.13

Pdss1-201, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tmem168Q91VX9 697 aa24.52■■□□□ 1.52
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa24.52■■□□□ 1.52
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tex13aA2AFS9 377 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cdh1P09803 884 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Spata48Q5NC83 441 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Atg16l2Q6KAU8 623 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mapk8Q91Y86 384 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Macrod1Q922B1 323 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 MceeQ9D1I5 178 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 AspmQ8CJ27 3122 aa24.51■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ctbp1O88712 441 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cyr61P18406 379 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gabpb1Q00420 383 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 GkQ64516 559 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nudcd1Q6PIP5 582 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ddrgk1Q80WW9 315 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mettl21cQ8BLU2 248 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nipal4Q8BZF2 406 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 NoboxQ8VIH1 527 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 PlvapQ91VC4 438 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mat2bQ99LB6 334 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mdm1Q9D067 708 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 4930548H24RikQ9D496 437 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Q9D979 236 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Wfdc11A2A5H7 82 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zfp780bE9Q2S6 806 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm3488M0QW81 238 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Opn1mwO35599 359 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pid1Q3UBG2 217 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ephx3Q3V1F8 367 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fam185aQ7TPD2 378 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Q810S2 196 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fkbp6Q91XW8 327 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ophn1Q99J31 802 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Csnk1dQ9DC28 415 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 CpqQ9WVJ3 470 aa24.5■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cilp2D3Z7H8 1162 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fignl2J3QK54 644 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Vmn2r39L7N2E5 861 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Top1Q04750 767 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cd300lgQ1ERP8 331 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tmem184cQ3TPR7 525 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Hdhd2Q3UGR5 259 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Afap1l2Q5DTU0 825 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mtus1Q5HZI1 1210 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 PfplQ5RKV8 702 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tsr1Q5SWD9 803 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sdf4Q61112 361 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sox11Q7M6Y2 395 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Slc8a2Q8K596 921 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Lrrc42Q8R2U7 421 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Olfr846Q8VET8 312 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Olfr1019Q8VGS3 310 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 CoprsQ9CQ13 173 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 XpotQ9CRT8 963 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Clcn5Q9WVD4 746 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa24.49■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pabpc4lG5E8X2 370 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Defa-rs2P17534 91 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fmo3P97501 534 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 FaxcQ3UMF9 409 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Psg28Q4KL66 472 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Phactr3Q8BYK5 558 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Olfr1502Q8VG66 316 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Senp8Q9D2Z4 221 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cep295Q8BQ48 2412 aa24.48■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Card9A2AIV8 536 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm3183D3YUJ6 481 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm3139J3QK78 481 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm3106J3QPH3 481 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ptgs1P22437 602 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 InhbcP55104 352 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Htr4P97288 388 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 ItkQ03526 625 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tnks2Q3UES3 1166 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Taar8aQ5QD07 344 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Xylt1Q811B1 953 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sfr1Q8BP27 319 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 LipmQ8K2A6 422 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 PinlypQ9CQD7 212 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Plce1Q8K4S1 2282 aa24.47■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cd151O35566 253 aa24.46■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ap1s1P61967 158 aa24.46■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 PrkcgP63318 697 aa24.46■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Casp4P70343 373 aa24.46■■□□□ 1.51
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Colec11Q3SXB8 272 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20 ms