Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Cdh1P09803 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cdh1P09803 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cdh1P09803 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cdh1P09803 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdh1P09803 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Cdh1P09803 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdh1P09803 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdh1P09803 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdh1P09803 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdh1P09803 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdh1P09803 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdh1P09803 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdh1P09803 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cdh1P09803 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cdh1P09803 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdh1P09803 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cdh1P09803 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cdh1P09803 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cdh1P09803 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Cdh1P09803 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cdh1P09803 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cdh1P09803 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cdh1P09803 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cdh1P09803 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cdh1P09803 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdh1P09803 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdh1P09803 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdh1P09803 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdh1P09803 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cdh1P09803 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cdh1P09803 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cdh1P09803 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdh1P09803 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdh1P09803 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdh1P09803 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cdh1P09803 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdh1P09803 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdh1P09803 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdh1P09803 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdh1P09803 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdh1P09803 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdh1P09803 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdh1P09803 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdh1P09803 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdh1P09803 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdh1P09803 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdh1P09803 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdh1P09803 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdh1P09803 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdh1P09803 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdh1P09803 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdh1P09803 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdh1P09803 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdh1P09803 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdh1P09803 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdh1P09803 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdh1P09803 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdh1P09803 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdh1P09803 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdh1P09803 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdh1P09803 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdh1P09803 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdh1P09803 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdh1P09803 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdh1P09803 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdh1P09803 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdh1P09803 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdh1P09803 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdh1P09803 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdh1P09803 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdh1P09803 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdh1P09803 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdh1P09803 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdh1P09803 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdh1P09803 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdh1P09803 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdh1P09803 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdh1P09803 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdh1P09803 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdh1P09803 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdh1P09803 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdh1P09803 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdh1P09803 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdh1P09803 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdh1P09803 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cdh1P09803 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdh1P09803 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdh1P09803 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh1P09803 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh1P09803 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdh1P09803 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdh1P09803 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdh1P09803 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdh1P09803 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdh1P09803 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdh1P09803 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdh1P09803 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdh1P09803 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdh1P09803 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 482 ms