Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Ophn1Q99J31 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ophn1Q99J31 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ophn1Q99J31 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Ophn1Q99J31 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ophn1Q99J31 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ophn1Q99J31 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ophn1Q99J31 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ophn1Q99J31 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ophn1Q99J31 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ophn1Q99J31 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ophn1Q99J31 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ophn1Q99J31 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ophn1Q99J31 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ophn1Q99J31 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ophn1Q99J31 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ophn1Q99J31 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ophn1Q99J31 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ophn1Q99J31 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ophn1Q99J31 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ophn1Q99J31 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ophn1Q99J31 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ophn1Q99J31 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ophn1Q99J31 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ophn1Q99J31 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ophn1Q99J31 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ophn1Q99J31 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ophn1Q99J31 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ophn1Q99J31 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
Ophn1Q99J31 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ophn1Q99J31 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ophn1Q99J31 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ophn1Q99J31 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ophn1Q99J31 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ophn1Q99J31 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ophn1Q99J31 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ophn1Q99J31 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ophn1Q99J31 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ophn1Q99J31 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ophn1Q99J31 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ophn1Q99J31 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ophn1Q99J31 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ophn1Q99J31 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ophn1Q99J31 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ophn1Q99J31 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ophn1Q99J31 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ophn1Q99J31 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ophn1Q99J31 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ophn1Q99J31 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ophn1Q99J31 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ophn1Q99J31 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ophn1Q99J31 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ophn1Q99J31 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ophn1Q99J31 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ophn1Q99J31 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ophn1Q99J31 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ophn1Q99J31 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ophn1Q99J31 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ophn1Q99J31 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ophn1Q99J31 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ophn1Q99J31 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ophn1Q99J31 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ophn1Q99J31 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ophn1Q99J31 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ophn1Q99J31 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ophn1Q99J31 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ophn1Q99J31 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ophn1Q99J31 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ophn1Q99J31 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ophn1Q99J31 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ophn1Q99J31 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ophn1Q99J31 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ophn1Q99J31 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ophn1Q99J31 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ophn1Q99J31 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ophn1Q99J31 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ophn1Q99J31 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ophn1Q99J31 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ophn1Q99J31 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ophn1Q99J31 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ophn1Q99J31 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ophn1Q99J31 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ophn1Q99J31 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ophn1Q99J31 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ophn1Q99J31 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ophn1Q99J31 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ophn1Q99J31 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ophn1Q99J31 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ophn1Q99J31 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ophn1Q99J31 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ophn1Q99J31 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ophn1Q99J31 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ophn1Q99J31 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ophn1Q99J31 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ophn1Q99J31 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ophn1Q99J31 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ophn1Q99J31 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ophn1Q99J31 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ophn1Q99J31 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ophn1Q99J31 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms