Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Opn1mwO35599 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Opn1mwO35599 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Opn1mwO35599 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Opn1mwO35599 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Opn1mwO35599 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Opn1mwO35599 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Opn1mwO35599 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Opn1mwO35599 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Opn1mwO35599 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Opn1mwO35599 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Opn1mwO35599 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Opn1mwO35599 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Opn1mwO35599 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Opn1mwO35599 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Opn1mwO35599 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Opn1mwO35599 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Opn1mwO35599 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Opn1mwO35599 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Opn1mwO35599 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Opn1mwO35599 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Opn1mwO35599 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Opn1mwO35599 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Opn1mwO35599 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Opn1mwO35599 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Opn1mwO35599 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Opn1mwO35599 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Opn1mwO35599 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Opn1mwO35599 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Opn1mwO35599 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Opn1mwO35599 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Opn1mwO35599 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Opn1mwO35599 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Opn1mwO35599 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Opn1mwO35599 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Opn1mwO35599 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Opn1mwO35599 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Opn1mwO35599 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Opn1mwO35599 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Opn1mwO35599 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Opn1mwO35599 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Opn1mwO35599 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Opn1mwO35599 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Opn1mwO35599 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Opn1mwO35599 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Opn1mwO35599 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Opn1mwO35599 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Opn1mwO35599 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Opn1mwO35599 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Opn1mwO35599 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Opn1mwO35599 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Opn1mwO35599 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Opn1mwO35599 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Opn1mwO35599 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Opn1mwO35599 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Opn1mwO35599 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Opn1mwO35599 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Opn1mwO35599 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Opn1mwO35599 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Opn1mwO35599 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Opn1mwO35599 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Opn1mwO35599 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Opn1mwO35599 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Opn1mwO35599 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Opn1mwO35599 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Opn1mwO35599 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Opn1mwO35599 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Opn1mwO35599 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Opn1mwO35599 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Opn1mwO35599 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Opn1mwO35599 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Opn1mwO35599 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Opn1mwO35599 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Opn1mwO35599 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Opn1mwO35599 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Opn1mwO35599 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Opn1mwO35599 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Opn1mwO35599 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Opn1mwO35599 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Opn1mwO35599 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Opn1mwO35599 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Opn1mwO35599 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Opn1mwO35599 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Opn1mwO35599 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Opn1mwO35599 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Opn1mwO35599 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Opn1mwO35599 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Opn1mwO35599 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Opn1mwO35599 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Opn1mwO35599 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Opn1mwO35599 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Opn1mwO35599 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Opn1mwO35599 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Opn1mwO35599 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Opn1mwO35599 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Opn1mwO35599 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Opn1mwO35599 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Opn1mwO35599 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Opn1mwO35599 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Opn1mwO35599 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
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