RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053729.13

Pdss1-201, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa53,37■■■■■ 6,13
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Abcc8B2RUS7 1588 aa50,99■■■■■ 5,75
Pdss1-201ENSMUST00000053729 ScribQ80U72 1612 aa48,73■■■■■ 5,39
Pdss1-201ENSMUST00000053729 NacadQ5SWP3 1504 aa47,42■■■■■ 5,18
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kdm5dQ62240 1548 aa47,32■■■■■ 5,17
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47,24■■■■■ 5,15
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sycp2Q9CUU3 1500 aa46,42■■■■■ 5,02
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rhox8Q6VSS7 320 aa46,27■■■■■ 5
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46,15■■■■■ 4,98
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Crybg2B7ZCC2 1516 aa45,47■■■■■ 4,87
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rtl1Q7M732 1744 aa44,12■■■■■ 4,65
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP44,04■■■■■ 4,64
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa43,82■■■■■ 4,61
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP43,65■■■■■ 4,58
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ercc6F8VPZ5 1481 aa43,41■■■■■ 4,54
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,19■■■■■ 4,5
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,17■■■■■ 4,5
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Wdr62Q3U3T8 1523 aa43,07■■■■■ 4,48
Pdss1-201ENSMUST00000053729 CftrP26361 1476 aa43,04■■■■■ 4,48
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa42,99■■■■■ 4,47
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Frmpd1A2AKB4 1549 aa42,99■■■■■ 4,47
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa42,96■■■■■ 4,47
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Synj1Q8CHC4 1574 aa42,94■■■■■ 4,46
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fam135aQ6NS59 1506 aa42,83■■■■■ 4,45
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Unc13aQ4KUS2 1712 aa42,32■■■■■ 4,37
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ubl4bQ9CQ84 188 aa42,24■■■■■ 4,35
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP41,87■■■■■ 4,29
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mrc2Q64449 1479 aa41,85■■■■■ 4,29
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Golga3P55937 1487 aa41,81■■■■■ 4,28
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kif15Q6P9L6 1387 aa41,68■■■■■ 4,26
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Lamc3Q9R0B6 1581 aa41,66■■■■■ 4,26
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Top2bQ64511 1612 aa41,66■■■■■ 4,26
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,55■■■■■ 4,24
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cux2P70298 1426 aa41,52■■■■■ 4,24
Pdss1-201ENSMUST00000053729 TnnQ80Z71 1560 aa41,35■■■■■ 4,21
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fmn1Q05860 1466 aa41,26■■■■■ 4,2
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ccdc18Q640L5 1455 aa41,12■■■■■ 4,17
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cep164Q5DU05 1446 aa41,1■■■■■ 4,17
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,98■■■■■ 4,15
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Camsap1A2AHC3 1581 aa40,95■■■■■ 4,15
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Il27Q8K3I6 234 aa40,82■■■■■ 4,13
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,8■■■■■ 4,12
Pdss1-201ENSMUST00000053729 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP40,78■■■■■ 4,12
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40,73■■■■■ 4,11
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP40,7■■■■■ 4,11
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 HrcG5E8J6 738 aa40,53■■■■■ 4,08
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Chic1Q8CBW7 227 aa40,5■■■■■ 4,07
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Crocc2F6XLV1 1638 aa40,5■■■■■ 4,07
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Grin2bQ01097 1482 aa40,48■■■■■ 4,07
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP40,41■■■■■ 4,06
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Plb1Q3TTY0 1478 aa40,4■■■■■ 4,06
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Duox2A2AQ99 1517 aa40,37■■■■■ 4,05
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP40,29■■■■■ 4,04
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Efcab5A0JP43 1406 aa40,28■■■■■ 4,04
Pdss1-201ENSMUST00000053729 NrkQ9R0G8 1455 aa40,25■■■■■ 4,03
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ift140E9PY46 1464 aa40,19■■■■■ 4,02
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Shroom4Q1W617 1475 aa40,03■■■■■ 4
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Disp1Q3TDN0 1521 aa39,91■■■■□ 3,98
Pdss1-201ENSMUST00000053729 PtprkP35822 1457 aa39,89■■■■□ 3,98
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP39,85■■■■□ 3,97
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rusc2Q80U22 1514 aa39,84■■■■□ 3,97
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP39,76■■■■□ 3,96
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Npm2Q80W85 207 aa39,68■■■■□ 3,94
Pdss1-201ENSMUST00000053729 SynmQ70IV5 1561 aa39,64■■■■□ 3,94
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Grin2aP35436 1464 aa39,64■■■■□ 3,94
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Magi3Q9EQJ9 1476 aa39,62■■■■□ 3,93
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Setd1bQ8CFT2 1985 aa39,58■■■■□ 3,93
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zeb1Q64318 1117 aa39,58■■■■□ 3,93
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa39,55■■■■□ 3,92
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa39,53■■■■□ 3,92
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gpatch8A2A6A1 1505 aa39,5■■■■□ 3,91
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Shroom2A2ALU4 1481 aa39,5■■■■□ 3,91
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pla2r1Q62028 1487 aa39,45■■■■□ 3,91
Pdss1-201ENSMUST00000053729 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP39,44■■■■□ 3,9
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Map3k1P53349 1493 aa39,38■■■■□ 3,89
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Arhgap35Q91YM2 1499 aa39,32■■■■□ 3,89
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Carmil1Q6EDY6 1374 aa39,26■■■■□ 3,88
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