Protein–RNA interactions for Protein: Q14BQ3

4930502E18Rik, MCG8350, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930502E18RikQ14BQ3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
4930502E18RikQ14BQ3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
4930502E18RikQ14BQ3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
4930502E18RikQ14BQ3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
4930502E18RikQ14BQ3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
4930502E18RikQ14BQ3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
4930502E18RikQ14BQ3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
4930502E18RikQ14BQ3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
4930502E18RikQ14BQ3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
4930502E18RikQ14BQ3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
4930502E18RikQ14BQ3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
4930502E18RikQ14BQ3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
4930502E18RikQ14BQ3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
4930502E18RikQ14BQ3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930502E18RikQ14BQ3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
4930502E18RikQ14BQ3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
4930502E18RikQ14BQ3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
4930502E18RikQ14BQ3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
4930502E18RikQ14BQ3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
4930502E18RikQ14BQ3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
4930502E18RikQ14BQ3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
4930502E18RikQ14BQ3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
4930502E18RikQ14BQ3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
4930502E18RikQ14BQ3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
4930502E18RikQ14BQ3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
4930502E18RikQ14BQ3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
4930502E18RikQ14BQ3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
4930502E18RikQ14BQ3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
4930502E18RikQ14BQ3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
4930502E18RikQ14BQ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
4930502E18RikQ14BQ3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
4930502E18RikQ14BQ3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930502E18RikQ14BQ3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
4930502E18RikQ14BQ3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
4930502E18RikQ14BQ3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
4930502E18RikQ14BQ3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
4930502E18RikQ14BQ3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
4930502E18RikQ14BQ3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
4930502E18RikQ14BQ3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4930502E18RikQ14BQ3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4930502E18RikQ14BQ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
4930502E18RikQ14BQ3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
4930502E18RikQ14BQ3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
4930502E18RikQ14BQ3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
4930502E18RikQ14BQ3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
4930502E18RikQ14BQ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930502E18RikQ14BQ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930502E18RikQ14BQ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
4930502E18RikQ14BQ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930502E18RikQ14BQ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
4930502E18RikQ14BQ3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930502E18RikQ14BQ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
4930502E18RikQ14BQ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
4930502E18RikQ14BQ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930502E18RikQ14BQ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930502E18RikQ14BQ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930502E18RikQ14BQ3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930502E18RikQ14BQ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930502E18RikQ14BQ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
4930502E18RikQ14BQ3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
4930502E18RikQ14BQ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
4930502E18RikQ14BQ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
4930502E18RikQ14BQ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
4930502E18RikQ14BQ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
4930502E18RikQ14BQ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
4930502E18RikQ14BQ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930502E18RikQ14BQ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930502E18RikQ14BQ3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
4930502E18RikQ14BQ3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930502E18RikQ14BQ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930502E18RikQ14BQ3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
4930502E18RikQ14BQ3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
4930502E18RikQ14BQ3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
4930502E18RikQ14BQ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
4930502E18RikQ14BQ3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
4930502E18RikQ14BQ3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
4930502E18RikQ14BQ3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
4930502E18RikQ14BQ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930502E18RikQ14BQ3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
4930502E18RikQ14BQ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
4930502E18RikQ14BQ3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
4930502E18RikQ14BQ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930502E18RikQ14BQ3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930502E18RikQ14BQ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930502E18RikQ14BQ3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930502E18RikQ14BQ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930502E18RikQ14BQ3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930502E18RikQ14BQ3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930502E18RikQ14BQ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930502E18RikQ14BQ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930502E18RikQ14BQ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930502E18RikQ14BQ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930502E18RikQ14BQ3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930502E18RikQ14BQ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930502E18RikQ14BQ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930502E18RikQ14BQ3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930502E18RikQ14BQ3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930502E18RikQ14BQ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930502E18RikQ14BQ3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930502E18RikQ14BQ3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms