RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mis18aQ9CZJ6 204 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Alkbh4Q9D8F1 300 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CatsperbA2RTF1 1109 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mptx2D3YYJ7 219 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mctp1E9PV86 951 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp780bE9Q2S6 806 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm20671F6TVX7 576 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sypl1O09117 261 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fgf10O35565 209 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 InaP46660 501 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cct5P80316 541 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 rp9P97762 213 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp607aQ3TQG9 686 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppp1r7Q3UM45 361 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sorbs1Q62417 1290 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 HjurpQ6PG16 667 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Snx32Q80ZJ7 404 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Epha10Q8BYG9 1007 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem161bQ8C2L6 487 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NelfbQ8C4Y3 580 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc35f5Q8R314 524 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 IqcdQ9D3V1 458 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Stx12Q9ER00 274 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fam205aA2APU8 1308 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm17535J3KMR8 224 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cldn2O88552 230 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pcmt1P23506 227 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TktP40142 623 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 RnaselQ05921 735 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccdc160Q3UYG1 323 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppm1nQ8BGL1 404 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rspry1Q8BVR6 576 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dennd1aQ8K382 1016 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp810Q99K45 461 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 2010109A12RikQ9D875 119 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tm9sf3Q9ET30 587 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr552E9Q545 317 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Serpinb9O08797 374 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wsb2O54929 404 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Stam2O88811 523 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrpap1P55302 360 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pbxip1Q3TVI8 727 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd37Q61470 281 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nt5eQ61503 576 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sgo2Q7TSY8 1164 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LssQ8BLN5 733 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 RadxQ8C779 850 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scamp1Q8K021 338 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccdc14Q8K2J4 934 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q91WD4 421 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 F11Q91Y47 624 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dqx1Q924H9 718 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 DmgdhQ9DBT9 869 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dio2Q9Z1Y9 266 aa7.27□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tsga10ipF7A1F0 157 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 C1qbpO35658 278 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 DtnbO70585 659 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lire1P11260 357 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ZfaP23607 742 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CskP41241 450 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc11a1P41251 548 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mtus1Q5HZI1 1210 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tbccd1Q640P7 552 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fbxw21Q8BI38 468 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vps26bQ8C0E2 336 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spata16Q8C636 571 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Asb14Q8C6Y6 587 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 HpgdQ8VCC1 269 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dus2Q9D7B1 493 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tlr5Q9JLF7 859 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wnt16Q9QYS1 364 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Copg1Q9QZE5 874 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp646Q6NV66 1788 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cyp4f17G3UW78 524 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r4K7N784 913 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Xbp1O35426 267 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ttc39dQ0VF76 604 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr867Q7TRF3 331 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Grhl1Q921D9 618 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mta3Q924K8 591 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc7a9Q9QXA6 487 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Il18bpQ9Z0M9 193 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm13101A2ASJ0 481 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3594E9Q2A7 267 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rgsl1H3BL40 1073 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Man2b1O09159 1013 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 XlrP05531 208 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Alkbh1P0CB42 389 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TubP50586 505 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 InscQ3HNM7 579 aa7.26□□□□□ -1.25
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SlmapQ3URD3 845 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.1 ms