Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,61■■■■□ 3,61
Copg1Q9QZE5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Copg1Q9QZE5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Copg1Q9QZE5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Copg1Q9QZE5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Copg1Q9QZE5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Copg1Q9QZE5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Copg1Q9QZE5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Copg1Q9QZE5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Copg1Q9QZE5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Copg1Q9QZE5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Copg1Q9QZE5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Copg1Q9QZE5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Copg1Q9QZE5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Copg1Q9QZE5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Copg1Q9QZE5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Copg1Q9QZE5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Copg1Q9QZE5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Copg1Q9QZE5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Copg1Q9QZE5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,58■■■□□ 2,49
Copg1Q9QZE5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Copg1Q9QZE5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Copg1Q9QZE5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Copg1Q9QZE5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Copg1Q9QZE5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Copg1Q9QZE5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Copg1Q9QZE5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Copg1Q9QZE5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Copg1Q9QZE5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Copg1Q9QZE5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Copg1Q9QZE5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Copg1Q9QZE5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Copg1Q9QZE5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Copg1Q9QZE5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Copg1Q9QZE5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Copg1Q9QZE5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Copg1Q9QZE5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Copg1Q9QZE5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Copg1Q9QZE5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Copg1Q9QZE5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Copg1Q9QZE5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Copg1Q9QZE5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Copg1Q9QZE5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Copg1Q9QZE5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Copg1Q9QZE5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Copg1Q9QZE5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Copg1Q9QZE5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Copg1Q9QZE5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Copg1Q9QZE5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Copg1Q9QZE5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Copg1Q9QZE5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Copg1Q9QZE5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Copg1Q9QZE5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Copg1Q9QZE5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Copg1Q9QZE5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Copg1Q9QZE5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Copg1Q9QZE5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,2
Copg1Q9QZE5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Copg1Q9QZE5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Copg1Q9QZE5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Copg1Q9QZE5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Copg1Q9QZE5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Copg1Q9QZE5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Copg1Q9QZE5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Copg1Q9QZE5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Copg1Q9QZE5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Copg1Q9QZE5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Copg1Q9QZE5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Copg1Q9QZE5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Copg1Q9QZE5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Copg1Q9QZE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Copg1Q9QZE5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Copg1Q9QZE5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Copg1Q9QZE5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Copg1Q9QZE5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Copg1Q9QZE5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Copg1Q9QZE5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Copg1Q9QZE5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Copg1Q9QZE5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Copg1Q9QZE5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Copg1Q9QZE5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Copg1Q9QZE5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Copg1Q9QZE5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Copg1Q9QZE5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Copg1Q9QZE5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Copg1Q9QZE5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Copg1Q9QZE5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Copg1Q9QZE5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Copg1Q9QZE5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Copg1Q9QZE5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Copg1Q9QZE5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Copg1Q9QZE5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Copg1Q9QZE5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Copg1Q9QZE5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Copg1Q9QZE5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Copg1Q9QZE5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Copg1Q9QZE5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Copg1Q9QZE5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Copg1Q9QZE5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Copg1Q9QZE5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms