Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V1

Iqcd, IQ domain-containing protein D, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IqcdQ9D3V1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
IqcdQ9D3V1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
IqcdQ9D3V1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
IqcdQ9D3V1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
IqcdQ9D3V1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
IqcdQ9D3V1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,78■■■□□ 2,84
IqcdQ9D3V1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
IqcdQ9D3V1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
IqcdQ9D3V1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
IqcdQ9D3V1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
IqcdQ9D3V1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
IqcdQ9D3V1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
IqcdQ9D3V1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
IqcdQ9D3V1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
IqcdQ9D3V1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
IqcdQ9D3V1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
IqcdQ9D3V1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
IqcdQ9D3V1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
IqcdQ9D3V1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
IqcdQ9D3V1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
IqcdQ9D3V1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
IqcdQ9D3V1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
IqcdQ9D3V1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
IqcdQ9D3V1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
IqcdQ9D3V1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
IqcdQ9D3V1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
IqcdQ9D3V1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
IqcdQ9D3V1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
IqcdQ9D3V1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
IqcdQ9D3V1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
IqcdQ9D3V1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
IqcdQ9D3V1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
IqcdQ9D3V1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
IqcdQ9D3V1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
IqcdQ9D3V1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
IqcdQ9D3V1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
IqcdQ9D3V1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
IqcdQ9D3V1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
IqcdQ9D3V1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
IqcdQ9D3V1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
IqcdQ9D3V1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
IqcdQ9D3V1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
IqcdQ9D3V1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
IqcdQ9D3V1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
IqcdQ9D3V1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
IqcdQ9D3V1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
IqcdQ9D3V1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
IqcdQ9D3V1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
IqcdQ9D3V1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
IqcdQ9D3V1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
IqcdQ9D3V1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
IqcdQ9D3V1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
IqcdQ9D3V1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
IqcdQ9D3V1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
IqcdQ9D3V1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
IqcdQ9D3V1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
IqcdQ9D3V1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
IqcdQ9D3V1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
IqcdQ9D3V1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
IqcdQ9D3V1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
IqcdQ9D3V1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
IqcdQ9D3V1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
IqcdQ9D3V1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
IqcdQ9D3V1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
IqcdQ9D3V1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
IqcdQ9D3V1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
IqcdQ9D3V1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
IqcdQ9D3V1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
IqcdQ9D3V1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
IqcdQ9D3V1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
IqcdQ9D3V1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
IqcdQ9D3V1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
IqcdQ9D3V1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
IqcdQ9D3V1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
IqcdQ9D3V1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
IqcdQ9D3V1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
IqcdQ9D3V1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
IqcdQ9D3V1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
IqcdQ9D3V1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
IqcdQ9D3V1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
IqcdQ9D3V1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
IqcdQ9D3V1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
IqcdQ9D3V1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
IqcdQ9D3V1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
IqcdQ9D3V1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
IqcdQ9D3V1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
IqcdQ9D3V1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
IqcdQ9D3V1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
IqcdQ9D3V1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
IqcdQ9D3V1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
IqcdQ9D3V1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
IqcdQ9D3V1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
IqcdQ9D3V1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
IqcdQ9D3V1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
IqcdQ9D3V1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
IqcdQ9D3V1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
IqcdQ9D3V1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
IqcdQ9D3V1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
IqcdQ9D3V1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
IqcdQ9D3V1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms