Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Tlr5Q9JLF7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Tlr5Q9JLF7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Tlr5Q9JLF7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tlr5Q9JLF7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Tlr5Q9JLF7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tlr5Q9JLF7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Tlr5Q9JLF7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Tlr5Q9JLF7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Tlr5Q9JLF7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tlr5Q9JLF7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Tlr5Q9JLF7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tlr5Q9JLF7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tlr5Q9JLF7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Tlr5Q9JLF7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tlr5Q9JLF7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Tlr5Q9JLF7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tlr5Q9JLF7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Tlr5Q9JLF7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tlr5Q9JLF7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tlr5Q9JLF7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tlr5Q9JLF7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tlr5Q9JLF7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tlr5Q9JLF7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tlr5Q9JLF7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Tlr5Q9JLF7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tlr5Q9JLF7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tlr5Q9JLF7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tlr5Q9JLF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tlr5Q9JLF7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tlr5Q9JLF7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Tlr5Q9JLF7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Tlr5Q9JLF7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tlr5Q9JLF7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Tlr5Q9JLF7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tlr5Q9JLF7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tlr5Q9JLF7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tlr5Q9JLF7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tlr5Q9JLF7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tlr5Q9JLF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tlr5Q9JLF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tlr5Q9JLF7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tlr5Q9JLF7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tlr5Q9JLF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tlr5Q9JLF7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tlr5Q9JLF7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Tlr5Q9JLF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tlr5Q9JLF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tlr5Q9JLF7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tlr5Q9JLF7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tlr5Q9JLF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Tlr5Q9JLF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tlr5Q9JLF7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tlr5Q9JLF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tlr5Q9JLF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tlr5Q9JLF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tlr5Q9JLF7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tlr5Q9JLF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Tlr5Q9JLF7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tlr5Q9JLF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tlr5Q9JLF7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Tlr5Q9JLF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tlr5Q9JLF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tlr5Q9JLF7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tlr5Q9JLF7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Tlr5Q9JLF7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tlr5Q9JLF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tlr5Q9JLF7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tlr5Q9JLF7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Tlr5Q9JLF7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tlr5Q9JLF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tlr5Q9JLF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tlr5Q9JLF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tlr5Q9JLF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tlr5Q9JLF7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tlr5Q9JLF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tlr5Q9JLF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tlr5Q9JLF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tlr5Q9JLF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tlr5Q9JLF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Tlr5Q9JLF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tlr5Q9JLF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tlr5Q9JLF7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tlr5Q9JLF7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tlr5Q9JLF7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tlr5Q9JLF7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tlr5Q9JLF7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tlr5Q9JLF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tlr5Q9JLF7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tlr5Q9JLF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Tlr5Q9JLF7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tlr5Q9JLF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tlr5Q9JLF7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tlr5Q9JLF7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tlr5Q9JLF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tlr5Q9JLF7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tlr5Q9JLF7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tlr5Q9JLF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms