Protein–RNA interactions for Protein: Q9D875

2010109A12Rik, MCG1041431, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109A12RikQ9D875 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
2010109A12RikQ9D875 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
2010109A12RikQ9D875 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
2010109A12RikQ9D875 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
2010109A12RikQ9D875 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
2010109A12RikQ9D875 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
2010109A12RikQ9D875 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
2010109A12RikQ9D875 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
2010109A12RikQ9D875 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
2010109A12RikQ9D875 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
2010109A12RikQ9D875 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
2010109A12RikQ9D875 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
2010109A12RikQ9D875 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
2010109A12RikQ9D875 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
2010109A12RikQ9D875 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
2010109A12RikQ9D875 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
2010109A12RikQ9D875 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
2010109A12RikQ9D875 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
2010109A12RikQ9D875 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
2010109A12RikQ9D875 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
2010109A12RikQ9D875 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
2010109A12RikQ9D875 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
2010109A12RikQ9D875 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
2010109A12RikQ9D875 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
2010109A12RikQ9D875 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
2010109A12RikQ9D875 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
2010109A12RikQ9D875 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
2010109A12RikQ9D875 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
2010109A12RikQ9D875 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
2010109A12RikQ9D875 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
2010109A12RikQ9D875 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
2010109A12RikQ9D875 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
2010109A12RikQ9D875 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
2010109A12RikQ9D875 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
2010109A12RikQ9D875 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
2010109A12RikQ9D875 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
2010109A12RikQ9D875 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
2010109A12RikQ9D875 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
2010109A12RikQ9D875 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
2010109A12RikQ9D875 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
2010109A12RikQ9D875 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
2010109A12RikQ9D875 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
2010109A12RikQ9D875 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
2010109A12RikQ9D875 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
2010109A12RikQ9D875 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
2010109A12RikQ9D875 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
2010109A12RikQ9D875 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
2010109A12RikQ9D875 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
2010109A12RikQ9D875 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
2010109A12RikQ9D875 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
2010109A12RikQ9D875 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
2010109A12RikQ9D875 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
2010109A12RikQ9D875 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
2010109A12RikQ9D875 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
2010109A12RikQ9D875 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
2010109A12RikQ9D875 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
2010109A12RikQ9D875 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
2010109A12RikQ9D875 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
2010109A12RikQ9D875 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
2010109A12RikQ9D875 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
2010109A12RikQ9D875 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
2010109A12RikQ9D875 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
2010109A12RikQ9D875 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
2010109A12RikQ9D875 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
2010109A12RikQ9D875 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
2010109A12RikQ9D875 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
2010109A12RikQ9D875 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
2010109A12RikQ9D875 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
2010109A12RikQ9D875 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
2010109A12RikQ9D875 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
2010109A12RikQ9D875 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
2010109A12RikQ9D875 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
2010109A12RikQ9D875 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
2010109A12RikQ9D875 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
2010109A12RikQ9D875 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
2010109A12RikQ9D875 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
2010109A12RikQ9D875 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
2010109A12RikQ9D875 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
2010109A12RikQ9D875 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
2010109A12RikQ9D875 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
2010109A12RikQ9D875 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
2010109A12RikQ9D875 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
2010109A12RikQ9D875 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
2010109A12RikQ9D875 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
2010109A12RikQ9D875 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
2010109A12RikQ9D875 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
2010109A12RikQ9D875 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
2010109A12RikQ9D875 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
2010109A12RikQ9D875 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
2010109A12RikQ9D875 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
2010109A12RikQ9D875 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
2010109A12RikQ9D875 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
2010109A12RikQ9D875 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
2010109A12RikQ9D875 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
2010109A12RikQ9D875 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
2010109A12RikQ9D875 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
2010109A12RikQ9D875 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
2010109A12RikQ9D875 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
2010109A12RikQ9D875 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
2010109A12RikQ9D875 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms