Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,29■■■■□ 3,24
Snx32Q80ZJ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Snx32Q80ZJ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Snx32Q80ZJ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Snx32Q80ZJ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Snx32Q80ZJ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Snx32Q80ZJ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Snx32Q80ZJ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Snx32Q80ZJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
Snx32Q80ZJ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,66■■■□□ 2,5
Snx32Q80ZJ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Snx32Q80ZJ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Snx32Q80ZJ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Snx32Q80ZJ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Snx32Q80ZJ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Snx32Q80ZJ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Snx32Q80ZJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Snx32Q80ZJ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Snx32Q80ZJ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Snx32Q80ZJ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Snx32Q80ZJ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Snx32Q80ZJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx32Q80ZJ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Snx32Q80ZJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Snx32Q80ZJ7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Snx32Q80ZJ7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Snx32Q80ZJ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Snx32Q80ZJ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Snx32Q80ZJ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Snx32Q80ZJ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Snx32Q80ZJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Snx32Q80ZJ7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Snx32Q80ZJ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Snx32Q80ZJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Snx32Q80ZJ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Snx32Q80ZJ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Snx32Q80ZJ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Snx32Q80ZJ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,45■■■□□ 2,15
Snx32Q80ZJ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Snx32Q80ZJ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Snx32Q80ZJ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Snx32Q80ZJ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Snx32Q80ZJ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Snx32Q80ZJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Snx32Q80ZJ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Snx32Q80ZJ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Snx32Q80ZJ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Snx32Q80ZJ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Snx32Q80ZJ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Snx32Q80ZJ7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Snx32Q80ZJ7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Snx32Q80ZJ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Snx32Q80ZJ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Snx32Q80ZJ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2,07
Snx32Q80ZJ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Snx32Q80ZJ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Snx32Q80ZJ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Snx32Q80ZJ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Snx32Q80ZJ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Snx32Q80ZJ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Snx32Q80ZJ7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Snx32Q80ZJ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Snx32Q80ZJ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Snx32Q80ZJ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Snx32Q80ZJ7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Snx32Q80ZJ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Snx32Q80ZJ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Snx32Q80ZJ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Snx32Q80ZJ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Snx32Q80ZJ7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Snx32Q80ZJ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Snx32Q80ZJ7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Snx32Q80ZJ7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Snx32Q80ZJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Snx32Q80ZJ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Snx32Q80ZJ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Snx32Q80ZJ7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Snx32Q80ZJ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Snx32Q80ZJ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Snx32Q80ZJ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Snx32Q80ZJ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Snx32Q80ZJ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Snx32Q80ZJ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Snx32Q80ZJ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Snx32Q80ZJ7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Snx32Q80ZJ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Snx32Q80ZJ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Snx32Q80ZJ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Snx32Q80ZJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Snx32Q80ZJ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Snx32Q80ZJ7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Snx32Q80ZJ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Snx32Q80ZJ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Snx32Q80ZJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Snx32Q80ZJ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Snx32Q80ZJ7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Snx32Q80ZJ7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Snx32Q80ZJ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Snx32Q80ZJ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Snx32Q80ZJ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms