Protein–RNA interactions for Protein: P55302

Lrpap1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrpap1P55302 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
Lrpap1P55302 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Lrpap1P55302 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Lrpap1P55302 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Lrpap1P55302 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Lrpap1P55302 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Lrpap1P55302 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Lrpap1P55302 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Lrpap1P55302 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Lrpap1P55302 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Lrpap1P55302 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Lrpap1P55302 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Lrpap1P55302 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Lrpap1P55302 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Lrpap1P55302 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Lrpap1P55302 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Lrpap1P55302 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Lrpap1P55302 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Lrpap1P55302 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Lrpap1P55302 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Lrpap1P55302 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Lrpap1P55302 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Lrpap1P55302 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Lrpap1P55302 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Lrpap1P55302 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lrpap1P55302 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Lrpap1P55302 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Lrpap1P55302 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lrpap1P55302 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Lrpap1P55302 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Lrpap1P55302 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Lrpap1P55302 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Lrpap1P55302 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Lrpap1P55302 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Lrpap1P55302 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Lrpap1P55302 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Lrpap1P55302 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Lrpap1P55302 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Lrpap1P55302 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Lrpap1P55302 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Lrpap1P55302 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Lrpap1P55302 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Lrpap1P55302 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Lrpap1P55302 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Lrpap1P55302 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Lrpap1P55302 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Lrpap1P55302 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Lrpap1P55302 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Lrpap1P55302 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Lrpap1P55302 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Lrpap1P55302 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Lrpap1P55302 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Lrpap1P55302 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Lrpap1P55302 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Lrpap1P55302 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Lrpap1P55302 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Lrpap1P55302 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Lrpap1P55302 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,54■■■□□ 2
Lrpap1P55302 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Lrpap1P55302 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Lrpap1P55302 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Lrpap1P55302 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lrpap1P55302 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lrpap1P55302 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lrpap1P55302 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lrpap1P55302 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lrpap1P55302 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lrpap1P55302 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lrpap1P55302 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Lrpap1P55302 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Lrpap1P55302 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Lrpap1P55302 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lrpap1P55302 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Lrpap1P55302 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Lrpap1P55302 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Lrpap1P55302 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Lrpap1P55302 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Lrpap1P55302 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Lrpap1P55302 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Lrpap1P55302 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Lrpap1P55302 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Lrpap1P55302 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Lrpap1P55302 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Lrpap1P55302 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Lrpap1P55302 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Lrpap1P55302 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Lrpap1P55302 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Lrpap1P55302 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Lrpap1P55302 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Lrpap1P55302 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Lrpap1P55302 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Lrpap1P55302 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Lrpap1P55302 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Lrpap1P55302 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Lrpap1P55302 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Lrpap1P55302 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Lrpap1P55302 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Lrpap1P55302 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Lrpap1P55302 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Lrpap1P55302 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,8 ms