Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,5■■■■■ 4,39
Pbxip1Q3TVI8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Pbxip1Q3TVI8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Pbxip1Q3TVI8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Pbxip1Q3TVI8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,33■■■■□ 3,57
Pbxip1Q3TVI8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Pbxip1Q3TVI8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,78■■■■□ 3,48
Pbxip1Q3TVI8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Pbxip1Q3TVI8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Pbxip1Q3TVI8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Pbxip1Q3TVI8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Pbxip1Q3TVI8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Pbxip1Q3TVI8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Pbxip1Q3TVI8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Pbxip1Q3TVI8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Pbxip1Q3TVI8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Pbxip1Q3TVI8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,84■■■■□ 3,17
Pbxip1Q3TVI8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Pbxip1Q3TVI8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Pbxip1Q3TVI8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Pbxip1Q3TVI8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Pbxip1Q3TVI8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Pbxip1Q3TVI8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Pbxip1Q3TVI8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Pbxip1Q3TVI8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Pbxip1Q3TVI8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Pbxip1Q3TVI8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Pbxip1Q3TVI8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Pbxip1Q3TVI8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Pbxip1Q3TVI8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Pbxip1Q3TVI8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Pbxip1Q3TVI8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Pbxip1Q3TVI8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Pbxip1Q3TVI8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Pbxip1Q3TVI8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Pbxip1Q3TVI8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Pbxip1Q3TVI8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Pbxip1Q3TVI8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Pbxip1Q3TVI8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Pbxip1Q3TVI8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Pbxip1Q3TVI8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Pbxip1Q3TVI8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Pbxip1Q3TVI8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Pbxip1Q3TVI8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Pbxip1Q3TVI8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Pbxip1Q3TVI8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Pbxip1Q3TVI8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Pbxip1Q3TVI8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Pbxip1Q3TVI8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Pbxip1Q3TVI8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Pbxip1Q3TVI8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Pbxip1Q3TVI8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Pbxip1Q3TVI8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Pbxip1Q3TVI8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Pbxip1Q3TVI8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Pbxip1Q3TVI8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Pbxip1Q3TVI8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Pbxip1Q3TVI8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Pbxip1Q3TVI8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pbxip1Q3TVI8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Pbxip1Q3TVI8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Pbxip1Q3TVI8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Pbxip1Q3TVI8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Pbxip1Q3TVI8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Pbxip1Q3TVI8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Pbxip1Q3TVI8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Pbxip1Q3TVI8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Pbxip1Q3TVI8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Pbxip1Q3TVI8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Pbxip1Q3TVI8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pbxip1Q3TVI8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pbxip1Q3TVI8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,02■■■□□ 2,72
Pbxip1Q3TVI8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Pbxip1Q3TVI8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,71
Pbxip1Q3TVI8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Pbxip1Q3TVI8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Pbxip1Q3TVI8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Pbxip1Q3TVI8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Pbxip1Q3TVI8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Pbxip1Q3TVI8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Pbxip1Q3TVI8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Pbxip1Q3TVI8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Pbxip1Q3TVI8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Pbxip1Q3TVI8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Pbxip1Q3TVI8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Pbxip1Q3TVI8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Pbxip1Q3TVI8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pbxip1Q3TVI8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pbxip1Q3TVI8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Pbxip1Q3TVI8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Pbxip1Q3TVI8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Pbxip1Q3TVI8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pbxip1Q3TVI8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pbxip1Q3TVI8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,39■■■□□ 2,62
Pbxip1Q3TVI8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Pbxip1Q3TVI8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Pbxip1Q3TVI8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Pbxip1Q3TVI8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms