Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Pcmt1P23506 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Pcmt1P23506 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Pcmt1P23506 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pcmt1P23506 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Pcmt1P23506 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Pcmt1P23506 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Pcmt1P23506 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Pcmt1P23506 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Pcmt1P23506 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Pcmt1P23506 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Pcmt1P23506 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pcmt1P23506 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Pcmt1P23506 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pcmt1P23506 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Pcmt1P23506 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Pcmt1P23506 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Pcmt1P23506 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pcmt1P23506 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Pcmt1P23506 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Pcmt1P23506 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pcmt1P23506 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Pcmt1P23506 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Pcmt1P23506 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Pcmt1P23506 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pcmt1P23506 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Pcmt1P23506 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Pcmt1P23506 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Pcmt1P23506 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pcmt1P23506 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Pcmt1P23506 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Pcmt1P23506 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Pcmt1P23506 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Pcmt1P23506 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pcmt1P23506 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Pcmt1P23506 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Pcmt1P23506 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pcmt1P23506 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pcmt1P23506 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pcmt1P23506 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Pcmt1P23506 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pcmt1P23506 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pcmt1P23506 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pcmt1P23506 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pcmt1P23506 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pcmt1P23506 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pcmt1P23506 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pcmt1P23506 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Pcmt1P23506 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pcmt1P23506 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Pcmt1P23506 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Pcmt1P23506 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Pcmt1P23506 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Pcmt1P23506 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Pcmt1P23506 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Pcmt1P23506 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Pcmt1P23506 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Pcmt1P23506 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,76■■□□□ 1,88
Pcmt1P23506 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Pcmt1P23506 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pcmt1P23506 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Pcmt1P23506 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Pcmt1P23506 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Pcmt1P23506 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Pcmt1P23506 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pcmt1P23506 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pcmt1P23506 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Pcmt1P23506 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Pcmt1P23506 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Pcmt1P23506 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Pcmt1P23506 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Pcmt1P23506 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pcmt1P23506 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Pcmt1P23506 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Pcmt1P23506 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Pcmt1P23506 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Pcmt1P23506 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Pcmt1P23506 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Pcmt1P23506 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Pcmt1P23506 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Pcmt1P23506 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Pcmt1P23506 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Pcmt1P23506 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pcmt1P23506 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pcmt1P23506 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Pcmt1P23506 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Pcmt1P23506 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Pcmt1P23506 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Pcmt1P23506 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Pcmt1P23506 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Pcmt1P23506 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Pcmt1P23506 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Pcmt1P23506 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Pcmt1P23506 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Pcmt1P23506 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pcmt1P23506 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Pcmt1P23506 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Pcmt1P23506 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Pcmt1P23506 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Pcmt1P23506 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,7 ms