RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 FUKQ8N0W3 1084 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CDKL2Q92772 493 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 FGF11Q92914 225 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ATP2A3Q93084 1043 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 FAF2Q96CS3 445 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 B3GALT6Q96L58 329 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 YY1AP1Q9H869 796 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SAR1AQ9NR31 198 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MRGBPQ9NV56 204 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DPP3Q9NY33 737 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 LACTBL1A8MY62 500 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF10BO14763 440 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TSPAN1O60635 241 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DDHD2O94830 711 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 FBXO21O94952 628 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 UNC5CO95185 931 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ZBED1O96006 694 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 RNF224P0DH78 156 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PDGFRAP16234 1089 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CA4P22748 312 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ITPKAP23677 461 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MIPP30301 263 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HTR7P34969 479 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GJC1P36383 396 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 FDFT1P37268 417 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DCTP40126 519 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A3Q01959 620 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 BNIP1Q12981 228 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TMED2Q15363 201 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DPYSL2Q16555 572 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 AMHR2Q16671 573 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GALNTL6Q49A17 601 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ATG16L1Q676U5 607 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 JADE1Q6IE81 842 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 LCA5Q86VQ0 697 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 FRMD1Q8N878 549 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TTC8Q8TAM2 541 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TFAP2BQ92481 460 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MSANTD3Q96H12 275 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CPXM1Q96SM3 734 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CALN1Q9BXU9 219 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.095e-9■■■■■ 51.3
GGA3-218ENST00000584243 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CNTN3Q9P232 1028 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SIX4Q9UIU6 781 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 A0A0U1RQF3 1178 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 F8W810 466 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 I3L4J1 428 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP33O14559 1287 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TYROBPO43914 113 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GCATO75600 419 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MT-ND3P03897 115 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 NFICP08651 508 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SERPINF2P08697 491 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 KCNE1P15382 129 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CCND1P24385 295 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ARL4AP40617 200 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HADHAP40939 763 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 VIPR2P41587 438 aa8.24□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 IFNAR2P48551 515 aa8.24□□□□□ -1.09
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