RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542838.5

DDX11-223, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX11, Length 3,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-223	ENST00000542838	ASB9	Q96DX5	294 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CCT7	Q99832	543 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	OMD	Q99983	421 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CSPG5	O95196	566 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF460	Q14592	562 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DGKD	Q16760	1214 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	HAUS8	Q9BT25	410 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ACOT9	Q9Y305	439 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TARM1	B6A8C7	271 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	AHSG	P02765	367 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	FGFR3	P22607	806 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ADRA1B	P35368	520 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838		Q3C1V9	767 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NPW	Q8N729	165 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838		C9IYK1	514 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CLDN5	O00501	218 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SDHD	O14521	159 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SPTLC1	O15269	473 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	BEST1	O76090	585 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CDH17	Q12864	832 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838		E7ENX8	843 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NCAM2	O15394	837 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GABRB3	P28472	473 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838		A0A0J9YVX5	310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PGK1	P00558	417 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	COL6A2	P12110	1019 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	AKAP5	P24588	427 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	COG7	P83436	770 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CTBP1	Q13363	440 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	IKBKE	Q14164	716 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF597	Q96LX8	424 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	MTSS1	O43312	755 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DDX11-223	ENST00000542838	NPHS1	O60500	1241 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DDX11-223	ENST00000542838	RECQL4	O94761	1208 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DDX11-223	ENST00000542838	JCHAIN	P01591	159 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DDX11-223	ENST00000542838	C8B	P07358	591 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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