RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 STAT1P42224 750 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CDK17Q00537 523 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 APBA1Q02410 837 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 C5orf22Q49AR2 442 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP40Q5TG30 622 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 GCNT7Q6ZNI0 430 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 TMIEQ8NEW7 156 aa23.64■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 KLK6Q92876 244 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CALN1Q9BXU9 219 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 DDIT4Q9NX09 232 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.64■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 SCAMP1O15126 338 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CLDN11O75508 207 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 SRCP12931 536 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 KLK7P49862 253 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM14Q14142 442 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 ARRDC3Q96B67 414 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 NOX5Q96PH1 765 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 DUSP23Q9BVJ7 150 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 FZD3Q9NPG1 666 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 THSD1Q9NS62 852 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 GPR27Q9NS67 375 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 EVA1BQ9NVM1 165 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 EPHB6O15197 1021 aa23.62■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 BNIP3LO60238 219 aa23.62■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 GNA15P30679 374 aa23.62■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CHRNA3P32297 505 aa23.62■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 SOX5P35711 763 aa23.62■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 PDCLQ13371 301 aa23.62■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 OR2A12Q8NGT7 310 aa23.62■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 RNF34Q969K3 372 aa23.62■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC114Q96M63 670 aa23.62■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 CAAP1Q9H8G2 361 aa23.62■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 TMEM259Q4ZIN3 620 aa23.61■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.61■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 ABCG4Q9H172 646 aa23.61■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.61■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa23.61■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 HSF2BPO75031 334 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 PRNPP04156 253 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 MYF5P13349 255 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CLCN1P35523 988 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 USP8P40818 1118 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CDH4P55283 916 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 CLDN2P57739 230 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 VSTM4Q8IW00 320 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 IFI44Q8TCB0 444 aa23.6■■□□□ 1.37
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SIMC1-208ENST00000495423 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 MUC3BQ9H195 1237 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 DYRK4Q9NR20 520 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 COX16Q9P0S2 106 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 PTPN13Q12923 2485 aa23.6■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.59■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SIMC1-208ENST00000495423 THAP12O43422 761 aa23.59■■□□□ 1.37
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