RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 ST8SIA2Q92186 375 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RABGGTAQ92696 567 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PTP4A1Q93096 173 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 NACC2Q96BF6 587 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PERPQ96FX8 193 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC114Q96M63 670 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 NEK1Q96PY6 1258 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 GORASP1Q9BQQ3 440 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 FUT8Q9BYC5 575 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 OPA3Q9H6K4 179 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 L2HGDHQ9H9P8 463 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 IL23AQ9NPF7 189 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 THAP1Q9NVV9 213 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 POGKQ9P215 609 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 AMACRQ9UHK6 382 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TUBE1Q9UJT0 475 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LIPT1Q9Y234 373 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MADDQ8WXG6 1647 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ABCC2Q92887 1545 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 EVC2Q86UK5 1308 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 AGAP5A6NIR3 686 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC53A6NM62 1247 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 H0YAE9 185 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PAGE4O60829 102 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 BBOX1O75936 387 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ITGB1P05556 798 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CHRM4P08173 479 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SPATA31D3P0C874 917 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PRR35P0CG20 571 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM11P17152 192 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ERCC2P18074 760 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CYP11B2P19099 503 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 IL10P22301 178 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CPT2P23786 658 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PBX3P40426 434 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEA9P43362 315 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF134P52741 427 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MVDP53602 400 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 INHBEP58166 350 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TIRAPP58753 221 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 COASYQ13057 564 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 BFSP2Q13515 415 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNB1Q14721 858 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RCN1Q15293 331 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF805Q5CZA5 627 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR93Q6P2C0 686 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MTFR2Q6P444 385 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 Q6ZUG5 572 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM110Q86TL2 294 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MCUQ8NE86 351 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms