RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229328.9

PRKAB1-201, Transcript of protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAB1, Length 2,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PSMG2Q969U7 264 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NT5MQ9NPB1 228 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PLIN3O60664 434 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 GLRA3O75311 464 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TGDSO95455 350 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 IL1BP01584 269 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PGGT1BP53609 377 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TLE2Q04725 743 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TRIM60Q495X7 471 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PCID2Q5JVF3 399 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ZNF398Q8TD17 642 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 VWCEQ96DN2 955 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CWH43Q9H720 699 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 MYLKQ15746 1914 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 DRGXA6NNA5 263 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 NEBLO76041 1014 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 MAGEA12P43365 314 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 OCRLQ01968 901 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SMARCB1Q12824 385 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 MPP3Q13368 585 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ANO4Q32M45 955 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 RANBP10Q6VN20 620 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ASRGL1Q7L266 308 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 KLC4Q9NSK0 619 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 FNIP2Q9P278 1114 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 MTRRQ9UBK8 725 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 AP3B1O00203 1094 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 BIRC5O15392 142 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 UNC5CO95185 931 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 T-ENOLP0DO92 83 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 KCNA4P22459 653 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ARFIP2P53365 341 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 WNT3AP56704 352 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 IRF9Q00978 393 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ATG16L1Q676U5 607 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 KDELC1Q6UW63 502 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ISL2Q96A47 359 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 KLHL29Q96CT2 875 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 HEY2Q9UBP5 337 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 GJB5O95377 273 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SEC24AO95486 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 PROCP04070 461 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ARNTP27540 789 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 GABRB3P28472 473 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ACVRL1P37023 503 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ITKQ08881 620 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 USP41Q3LFD5 358 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 C7orf26Q96N11 449 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SP110Q9HB58 689 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 HAO1Q9UJM8 370 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 GJB3O75712 270 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 VAPBO95292 243 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 CBX6O95503 412 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKAB1-201ENST00000229328 MMP2P08253 660 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms