RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405943.3

HDGFP1-201, Transcript of heparin binding growth factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene HDGFP1, Length 252 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP1-201ENST00000405943 CYP2U1Q7Z449 544 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 STRA8Q7Z7C7 330 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 TRIM50Q86XT4 487 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SFRP1Q8N474 314 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 DCLK2Q8N568 766 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RNF169Q8NCN4 708 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 PCDH19Q8TAB3 1148 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 CXorf38Q8TB03 319 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 URGCPQ8TCY9 931 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 AKT1S1Q96B36 256 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 MASTLQ96GX5 879 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SCYL1Q96KG9 808 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 COG8Q96MW5 612 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 AGAP3Q96P47 875 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ZNF347Q96SE7 839 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 CPXM1Q96SM3 734 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 CIB1Q99828 191 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ADI1Q9BV57 179 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 BCO2Q9BYV7 579 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ZNF541Q9H0D2 1346 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 ZNF385DQ9H6B1 395 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.59□□□□□ -1.67
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HDGFP1-201ENST00000405943 INIPQ9NRY2 104 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 COL20A1Q9P218 1284 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 EBF1Q9UH73 591 aa4.59□□□□□ -1.67
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HDGFP1-201ENST00000405943 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 CROTQ9UKG9 612 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 SARDHQ9UL12 918 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 PSME2Q9UL46 239 aa4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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HDGFP1-201ENST00000405943 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDGFP1-201ENST00000405943 RAD54BQ9Y620 910 aa4.59□□□□□ -1.67
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HDGFP1-201ENST00000405943 A0A087X1B8 175 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.58□□□□□ -1.68
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HDGFP1-201ENST00000405943 NFIBO00712 420 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 MRASO14807 208 aa4.58□□□□□ -1.68
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HDGFP1-201ENST00000405943 PFDN6O15212 129 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 NCAM2O15394 837 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 GRID2O43424 1007 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 B4GALT4O60513 344 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 CSPG5O95196 566 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 RASAL1O95294 804 aa4.58□□□□□ -1.68
HDGFP1-201ENST00000405943 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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