RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 SHISA7A6NL88 538 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC188H7C350 402 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 MATN3O15232 486 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 STARD6P59095 220 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 SNX1Q13596 522 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 SIX5Q8N196 739 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC26Q8TAB7 109 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 LRRN4Q8WUT4 740 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 ERVW-1Q9UQF0 538 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 HS3ST2Q9Y278 367 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP69A5D8W1 941 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 KRBA1A5PL33 1030 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 PHF2O75151 1096 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 NNMTP40261 264 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 OASLQ15646 514 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO43Q4G163 708 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 LINGO4Q6UY18 593 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SFTPA1Q8IWL2 248 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF148Q9UQR1 794 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 VASPP50552 380 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ST8SIA6P61647 398 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 TMCO4Q5TGY1 634 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 HTR3CQ8WXA8 447 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SORCS1Q8WY21 1168 aa28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 K7EQS6 105 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 EGFP01133 1207 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ITGAVP06756 1048 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CD72P21854 359 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 RBL1P28749 1068 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 RENBPP51606 427 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 BBS5Q8N3I7 341 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ATP11CQ8NB49 1132 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 KDM1BQ8NB78 822 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 KCNV2Q8TDN2 545 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 MAML1Q92585 1016 aa28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 NPC1O15118 1278 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CCNB1P14635 433 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 VAV1P15498 845 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CHRNA3P32297 505 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 FNTAP49354 379 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CLCN6P51797 869 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 MARC1Q5VT66 337 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 LEKR1Q6ZMV7 388 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 MNS1Q8NEH6 495 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA4Q8NEY3 305 aa28.3■■■□□ 2.12
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM121Q9BTD3 319 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SLC8A2Q9UPR5 921 aa28.3■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 KANSL1LA0AUZ9 987 aa28.29■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 KCNK1O00180 336 aa28.29■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 NEBLO76041 1014 aa28.29■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CD160O95971 181 aa28.29■■■□□ 2.12
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GIPC1-201ENST00000345425 STIP1P31948 543 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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GIPC1-201ENST00000345425 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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GIPC1-201ENST00000345425 SH2D3CQ8N5H7 860 aa28.29■■■□□ 2.12
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GIPC1-201ENST00000345425 KCNN4O15554 427 aa28.29■■■□□ 2.12
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GIPC1-201ENST00000345425 STK10O94804 968 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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GIPC1-201ENST00000345425 C10orf88Q9H8K7 445 aa28.29■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ACTL7AQ9Y615 435 aa28.29■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SRCP12931 536 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC14Q08ET2 396 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF235Q14590 738 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 DGKKQ5KSL6 1271 aa28.28■■■□□ 2.12
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC105Q8IYK2 499 aa28.28■■■□□ 2.12
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