RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q6ZSR6	202 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLK6	Q92876	244 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF34	Q969K3	372 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	DYRK4	Q9NR20	520 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691		A6NNZ2	444 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLD2	O14939	933 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	MCF2L	O15068	1137 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPTLC2	O15270	562 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSF2	P04141	144 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD19	P15391	556 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	VAV1	P15498	845 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CASP1	P29466	404 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	GTF2H1	P32780	548 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	METAP1	P53582	386 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	DAOA	P59103	153 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPP3CA	Q08209	521 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPIDR	Q14159	915 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT39	Q6A163	491 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	JAML	Q86YT9	394 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	LGI2	Q8N0V4	545 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	FRS2	Q8WU20	508 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	NAT6	Q93015	286 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	STRADB	Q9C0K7	418 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	TPP1	O14773	563 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	MUSK	O15146	869 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	AQP9	O43315	295 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPP6R2	O75170	966 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDH8	O95206	1070 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	APOE	P02649	317 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	LTF	P02788	710 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CR2	P20023	1033 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC5A2	P31639	672 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLDN2	P57739	230 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	STK4	Q13043	487 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	NNT	Q13423	1086 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CUL4B	Q13620	913 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	DLG2	Q15700	870 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PARG	Q86W56	976 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	BSN	Q9UPA5	3926 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATP9B	O43861	1147 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	BNIP3L	O60238	219 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	STX10	O60499	249 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CUTA	O60888	179 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO21	O94952	628 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	NEFL	P07196	543 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	LIPC	P11150	499 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TXNRD1-223	ENST00000531691	VDR	P11473	427 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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