RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CST6Q15828 149 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SYT12Q8IV01 421 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 STK40Q8N2I9 435 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FOXJ1Q92949 421 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FAM129BQ96TA1 746 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM5Q9C035 493 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DNAI1Q9UI46 699 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NUMA1Q14980 2115 aa20.38■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CBX4O00257 560 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CREB3O43889 395 aa20.37■□□□□ 0.85
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CTPS1-206ENST00000470271 MT-CO1P00395 513 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SRCP12931 536 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GLDCP23378 1020 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ETFBP38117 255 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PI4KAP42356 2102 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RETSATQ6NUM9 610 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 LINGO4Q6UY18 593 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 USP30Q70CQ3 517 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TCEAL3Q969E4 200 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DEF6Q9H4E7 631 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NENFQ9UMX5 172 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.37■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MID1O15344 667 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PRPSAP2O60256 369 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CYP1A2P05177 515 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MIPP30301 263 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 HOXD12P35452 270 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PSMD8P48556 350 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CLCN6P51797 869 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GALCP54803 685 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SEMA3BQ13214 749 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ACAP1Q15027 740 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SLC18A3Q16572 532 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 IL31Q6EBC2 164 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 Q6ZVU0 165 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GANCQ8TET4 914 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RMDN1Q96DB5 314 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PEBP4Q96S96 227 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NUP85Q9BW27 656 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RBSNQ9H1K0 784 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PATE3B3GLJ2 98 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 K7ERQ8 282 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 GDF9O60383 454 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RAMP2O60895 175 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 LRCH4O75427 683 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ZMPSTE24O75844 475 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ADH1BP00325 375 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 IL1BP01584 269 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SDHBP21912 280 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SLC8A1P32418 973 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ACSL1P33121 698 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 HTR7P34969 479 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PCK1P35558 622 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ACVRL1P37023 503 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ID4P47928 161 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SLC20A2Q08357 652 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CNGA4Q8IV77 575 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.35■□□□□ 0.85
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