RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CERS3Q8IU89 383 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 STAMQ92783 540 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM160Q9NX00 188 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 GGA3Q9NZ52 723 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 UPB1Q9UBR1 384 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 GDAQ9Y2T3 454 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM247A6NEH6 219 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ANP32CO43423 234 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ATG13O75143 517 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK4P11802 303 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HNF1BP35680 557 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC16A2P36021 539 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MTNR1AP48039 350 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ATG16L1Q676U5 607 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 AADACL2Q6P093 401 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 AAGABQ6PD74 315 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC25Q86WR0 208 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NCSTNQ92542 709 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HIPK3Q9H422 1215 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 COG5Q9UP83 839 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 A6NNC1 897 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PEX12O00623 359 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRNB1P11230 501 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 GJC1P36383 396 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ME1P48163 572 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TLE2Q04725 743 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 IL13RA2Q14627 380 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ALG10Q5BKT4 473 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGGTB-202ENST00000370826 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAIQ8N9R8 606 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF7Q9UBF6 113 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ICKQ9UPZ9 632 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC189A1A4V9 331 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NPHP1O15259 732 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 STRNO43815 780 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 DDAH2O95865 285 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FGF2P09038 288 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 WEE2P0C1S8 567 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-202ENST00000370826 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PKP1Q13835 747 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP21Q8N119 569 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NRACQ8N912 160 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SETD9Q8NE22 299 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAR1Q8WVX9 515 aa4.19□□□□□ -1.74
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