RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP3CCP48454 512 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 EPHB3P54753 998 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 STX5Q13190 355 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ADGRD1Q6QNK2 874 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CMC1Q7Z7K0 106 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 KYQ8NBH2 561 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 OR6K2Q8NGY2 324 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 P2RY11Q96G91 374 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 B3GALT6Q96L58 329 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 GPR88Q9GZN0 384 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 RUBCNLQ9H714 662 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 EFR3BQ9Y2G0 817 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF197O14709 1029 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 TPP1O14773 563 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 GLP2RO95838 553 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 RGS4P49798 205 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NOGQ13253 232 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 GLIS1Q8NBF1 620 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NDNQ99608 321 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 C4AP0C0L4 1744 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 C4BP0C0L5 1744 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 SOAT2O75908 522 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CD86P42081 329 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NR2C2P49116 596 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 SPRED3Q2MJR0 410 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 LRRC52Q8N7C0 313 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 SNX31Q8N9S9 440 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NDUFA13Q9P0J0 144 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 RABGEF1Q9UJ41 708 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 GRK4P32298 578 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PRKCZQ05513 592 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 LRRC74AQ0VAA2 488 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PSMD5Q16401 504 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 TMEM86AQ8N2M4 240 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 WWOXQ9NZC7 414 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PKD2L2Q9NZM6 624 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NCAM2O15394 837 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 KATNA1O75449 491 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 FGFR1P11362 822 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGAP8P85298 464 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 LCLAT1Q6UWP7 414 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 C11orf96Q7Z7L8 435 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 DENND1CQ8IV53 801 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 DPF3Q92784 378 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 HOXA2O43364 376 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ZMPSTE24O75844 475 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ANPEPP15144 967 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NOVP48745 357 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 GSCP56915 257 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGAP1Q07960 439 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 THAP11Q96EK4 314 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 RGS20O76081 388 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 HOXC6P09630 235 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 RPL17P18621 184 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PGAM1P18669 254 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CD151P48509 253 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ULK2Q8IYT8 1036 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CD101Q93033 1021 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 DUSP16Q9BY84 665 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 SNX13Q9Y5W8 968 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 TRPC5OSA6NMA1 111 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CRHR2Q13324 411 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 BLMHQ13867 455 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 MPP2Q14168 576 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 INPP5AQ14642 412 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 ABCC13Q9NSE7 274 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NWD2Q9ULI1 1742 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PTPRJQ12913 1337 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 HEATR9A2RTY3 570 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CCNB1P14635 433 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PTK2BQ14289 1009 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 SNX32Q86XE0 403 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CXorf38Q8TB03 319 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CATSPER2Q96P56 530 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 FZD8Q9H461 694 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 BPIFA1Q9NP55 256 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 MAN1C1Q9NR34 630 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 APPL1Q9UKG1 709 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 MOXD2PA6NHM9 499 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CCL22O00626 93 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 GDF10P55107 478 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 NPLOC4Q8TAT6 608 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CDHR5Q9HBB8 845 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 CDH9Q9ULB4 789 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD40-201ENST00000285243 PCDHGB4Q9UN71 923 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms