RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZSCAN12O43309 604 aa12.01□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFA10O95299 355 aa12.01□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 CYP27A1Q02318 531 aa12.01□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 FMO1Q01740 532 aa12□□□□□ -0.49
CAPNS1-209ENST00000590049 SMARCB1Q12824 385 aa12□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 C12orf29Q8N999 325 aa12□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 TSPAN16Q9UKR8 245 aa12□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 KCNAB2Q13303 367 aa11.99□□□□□ -0.49
CAPNS1-209ENST00000590049 DHCR24Q15392 516 aa11.99□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.99□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 CHPFQ8IZ52 775 aa11.99□□□□□ -0.49
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.99□□□□□ -0.49
CAPNS1-209ENST00000590049 GIPC2Q8TF65 315 aa11.99□□□□□ -0.49
CAPNS1-209ENST00000590049 TFAP2BQ92481 460 aa11.99□□□□□ -0.49
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM11Q96F44 468 aa11.99□□□□□ -0.49
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CAPNS1-209ENST00000590049 LHX5Q9H2C1 402 aa11.99□□□□□ -0.49
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