RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 H7C2Y5 167 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RIPK2O43353 540 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MGRN1O60291 552 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFS2O75306 463 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 B3GAT3O94766 335 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TJP3O95049 919 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 COL6A1P12109 1028 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATF2P15336 505 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ALOX12P18054 663 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NPR2P20594 1047 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNA3P32297 505 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PFKPQ01813 784 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SLC34A1Q06495 639 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF846Q147U1 533 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 STK33Q9BYT3 514 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 A8MVJ9 347 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 O00370 1275 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BNIP3LO60238 219 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BCL10O95999 233 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 RENBPP51606 427 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EPS8Q12929 822 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CDH18Q13634 790 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 ZPBP2Q6X784 338 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PPTC7Q8NI37 304 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FANK1Q8TC84 345 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 TLE6Q9H808 572 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 THAP1Q9NVV9 213 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OR6C75A6NL08 312 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 F5H423 210 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 INSRRP14616 1297 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NPEPPSP55786 919 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NCAPHQ15003 741 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SGCDQ92629 289 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 SPON2Q9BUD6 331 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 BRD7Q9NPI1 651 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ASAH2Q9NR71 780 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DPP3Q9NY33 737 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 POTEMA6NI47 508 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 F5H5T6 163 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 M0R3G1 203 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KCNH1O95259 989 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 M6PRP20645 277 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DEFA6Q01524 100 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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