RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 CATSPER2Q96P56 530 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CROTQ9UKG9 612 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 H3BMM5 538 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SPTLC1O15269 473 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PGK1P00558 417 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SPG21Q9NZD8 308 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP6V1B1P15313 513 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CAPZA2P47755 286 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 NUP107P57740 925 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PLCL1Q15111 1095 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CASZ1Q86V15 1759 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGAVP06756 1048 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SP3Q02447 781 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 UGCGQ16739 394 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ALLCQ8N6M5 410 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 AP4S1Q9Y587 144 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP4AP20648 1035 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PSMB4P28070 264 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 DEFA1P59665 94 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 DEFA3P59666 94 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 EVX2Q03828 476 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 RGMBQ6NW40 437 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 14.1
SH3BP4-203ENST00000409212 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PADI4Q9UM07 663 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ACTL7BQ9Y614 415 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SLIT3O75094 1523 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 RASSF9O75901 435 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF682O95780 498 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 MAPK8P45983 427 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ARSHQ5FYA8 562 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 COMMD8Q9NX08 183 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 COL1A2P08123 1366 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 KATNA1O75449 491 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 IMPDH2P12268 514 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 BLVRAP53004 296 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 VPS51Q9UID3 782 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 DERAQ9Y315 318 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 BTN3A1O00481 513 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF862O60290 1169 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 RPN2P04844 631 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CSH1P0DML2 217 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CSH2P0DML3 217 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ADRA1DP25100 572 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM60Q495X7 471 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 AADACL2Q6P093 401 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 IYDQ6PHW0 289 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 MTSS1LQ765P7 747 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PRELID2Q8N945 189 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SERAC1Q96JX3 654 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CAPN10Q9HC96 672 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF19AQ9NV58 838 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CALCAP01258 141 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP6V1B2P21281 511 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 SERPINB3P29508 390 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 USP45Q70EL2 814 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 BTBD10Q9BSF8 475 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ABHD2P08910 425 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP2R1BP30154 601 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms