RNA–Protein interactions for RNA: YOR036W

PEP12, Transcript of Target membrane receptor (t-SNARE), yeast

Gene PEP12, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEP12	YOR036W	RNQ1	P25367	405 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	GUP1	P53154	560 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	NCE103	P53615	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	SOG2	Q08817	791 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	UBP5	P39944	805 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	SDH1	Q00711	640 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	LRG1	P35688	1017 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PEP12	YOR036W	ERS1	P17261	260 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	SEG2	P34250	1132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	LEM3	P42838	414 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	ELG1	Q12050	791 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	FUS1	P11710	512 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	KTR2	P33550	425 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	RGD2	P43556	714 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	PUN1	Q06991	263 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	PUP1	P25043	261 aa		5	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	AIM46	P38885	310 aa		5	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	SPO71	Q03868	1245 aa		5	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	TAF7	Q05021	590 aa		5	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	CPS1	P27614	576 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	LEO1	P38439	464 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	HXT8	P40886	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	FIR1	P40020	876 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	NEO1	P40527	1151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	GIC2	Q06648	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	YJR124C	P47159	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEP12	YOR036W	SRS2	P12954	1174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	YBR287W	P38355	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	NIT1	P40447	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	DFG16	Q99234	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	NTA1	P40354	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	APC11	Q12157	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	GLO4	Q12320	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	YCR015C	P25616	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	ECL1	P48235	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	RPB10	P22139	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	MMM1	P41800	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	YML083C	Q04526	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEP12	YOR036W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	YKL222C	P35995	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	GPT2	P36148	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	YHL008C	P38750	627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	RAD55	P38953	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	PSY2	P40164	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	FET4	P40988	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	FAR11	P53917	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	CIT3	P43635	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	CDA2	Q06703	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	TAF1	P46677	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	PNP1	Q05788	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	ESC8	Q08119	714 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	HSP78	P33416	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	RRN6	P32786	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	RCM1	P53972	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	CTR9	P89105	1077 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	NSI1	Q12457	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	SMC1	P32908	1225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	THI80	P35202	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP12	YOR036W	COB	P00163	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	DMA2	P53924	522 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	GIP4	P39732	760 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	EAR1	Q03212	550 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	BOL3	P39724	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	GCV1	P48015	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	YIG1	Q08956	461 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	RIM11	P38615	370 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	ORC3	P54790	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	NPR1	P22211	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	ADP1	P25371	1049 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	DUR3	P33413	735 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEP12	YOR036W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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