RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	ACF4	P47129	309 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MGR3	YMR115W	UFD2	P54860	961 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MGR3	YMR115W	SOG2	Q08817	791 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MGR3	YMR115W	AI3	P03877	415 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MGR3	YMR115W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
MGR3	YMR115W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	GUP1	P53154	560 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	YPL034W	Q03083	165 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	SFA1	P32771	386 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	ERP5	P38819	212 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	HAT1	Q12341	374 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	SAC7	P17121	654 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	RSC4	Q02206	625 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	PAN5	P38787	379 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	LEM3	P42838	414 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	TRS120	Q04183	1289 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	MDJ2	P42834	146 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	CTR9	P89105	1077 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	GLO4	Q12320	285 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	YJR124C	P47159	448 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	DSE4	P53753	1117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	MNL2	Q12205	849 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	HVG1	P0CE11	249 aa		7.52	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.2
MGR3	YMR115W	YNR065C	P53751	1116 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	YNL011C	P53980	444 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	COB	P00163	385 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	RSC6	P25632	483 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	NEO1	P40527	1151 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	SPO71	Q03868	1245 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	FRT1	Q99332	602 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	CDC55	Q00362	526 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	NUT2	Q06213	157 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	FET4	P40988	552 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	BSC2	Q05611	235 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MGR3	YMR115W	DUR3	P33413	735 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	ELG1	Q12050	791 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	GPI13	Q07830	1017 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	RIM11	P38615	370 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	REC8	Q12188	680 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	YHL008C	P38750	627 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	MSH6	Q03834	1242 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	FLP1	P03870	423 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	ERS1	P17261	260 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	COQ2	P32378	372 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	NPR1	P22211	790 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	NCE103	P53615	221 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	YHL050C	P38721	697 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	YHR219W	P38900	624 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	SAF1	P38352	637 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	AKR1	P39010	764 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	YLR122C	Q12312	125 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MGR3	YMR115W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	FAR11	P53917	953 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	KAE1	P36132	386 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	SAP155	P43612	1002 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	NUT1	P53114	1132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.37	□□□□□ -1.23	not detected
MGR3	YMR115W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.37	□□□□□ -1.23	not detected
MGR3	YMR115W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	SAM37	P50110	327 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	YMR074C	Q04773	145 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	PMT7	Q06644	662 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	YIG1	Q08956	461 aa		7.36	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	TRP3	P00937	484 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	CHS2	P14180	963 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	GCV1	P48015	400 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	YAF9	P53930	226 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
MGR3	YMR115W	MAC1	P35192	417 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	OMA1	P36163	345 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	MON1	P53129	644 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	YOR223W	Q12015	292 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	YKR073C	P36153	106 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	PPX1	P38698	397 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	INP52	P50942	1183 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	MED7	Q08278	222 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	YLL054C	Q12244	843 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24

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