RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	TY4A-J	P47023	414 aa		5.47	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	YJL007C	P47080	104 aa		5.47	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	SVF1	Q05515	481 aa		5.47	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	WTM2	Q12206	467 aa		5.47	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5.47	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.46	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	UTR2	P32623	467 aa		5.45	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	SLA1	P32790	1244 aa		5.45	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	SSN3	P39073	555 aa		5.45	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	APL6	P46682	809 aa		5.45	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	PKC1	P24583	1151 aa		5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	SEC20	P28791	383 aa		5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	PPG1	P32838	368 aa		5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	ATG32	P40458	529 aa		5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	PDR11	P40550	1411 aa		5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	RNH70	P53331	553 aa		5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	HAT1	Q12341	374 aa		5.44	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	IML1	P47170	1584 aa		5.43	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	TSR4	P25040	408 aa		5.43	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	CPS1	P27614	576 aa		5.43	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	TPM2	P40414	161 aa		5.43	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	YPP1	P46951	817 aa		5.43	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	MCM16	Q12262	181 aa		5.43	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	EMP47	P43555	445 aa		5.42	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	GCN2	P15442	1659 aa		5.41	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	SKN7	P38889	622 aa		5.41	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.41	□□□□□ -1.54	RIP-Chip
KTR2	YKR061W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.41	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	GAL11	P19659	1081 aa		5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	YBL036C	P38197	257 aa		5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	SUM1	P46676	1062 aa		5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	YMR187C	Q03236	431 aa		5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
KTR2	YKR061W	USO1	P25386	1790 aa		5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	TTI1	P36097	1038 aa		5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	AIM21	P40563	679 aa		5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5.39	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	RAD2	P07276	1031 aa		5.38	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	FPS1	P23900	669 aa		5.38	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	MET1	P36150	593 aa		5.38	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	TDA6	Q06466	467 aa		5.38	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	ERP2	P39704	215 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	THI12	P42883	340 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	THI5	P43534	340 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	JJJ2	P46997	583 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	THI11	P47183	340 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	ALD2	P47771	506 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	THI13	Q07748	340 aa		5.37	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	IRE1	P32361	1115 aa		5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	BOI2	P39969	1040 aa		5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	YGL081W	P53156	320 aa		5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	YNR014W	P53719	212 aa		5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	RAV1	P47104	1357 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	KAR1	P11927	433 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	IES1	P43579	692 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.35	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	ISF1	P32488	338 aa		5.34	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	ISW1	P38144	1129 aa		5.34	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
KTR2	YKR061W	DPB3	P27344	201 aa		5.33	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	POL32	P47110	350 aa		5.33	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.9 ms