RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	BSC2	Q05611	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSE4	YKL049C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSE4	YKL049C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSE4	YKL049C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	NHA1	Q99271	985 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	IPL1	P38991	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	THI12	P42883	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	THI5	P43534	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	THI11	P47183	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	CTR9	P89105	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	TDA6	Q06466	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	THI13	Q07748	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	TFA2	P36145	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	YHL008C	P38750	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	SAM37	P50110	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	SLP1	Q12232	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	WHI5	Q12416	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	COB	P00163	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	GIP2	P40036	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	SOG2	Q08817	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	MET4	P32389	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	TED1	P40533	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	GLO4	Q12320	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	FLP1	P03870	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	YJR124C	P47159	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	GUP1	P53154	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	RRM3	P38766	723 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	NEO1	P40527	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	LEM3	P42838	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	LSB6	P42951	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSE4	YKL049C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	DUR3	P33413	735 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	PAN5	P38787	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	VPS35	P34110	944 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	RIM11	P38615	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	FET4	P40988	552 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	NUT1	P53114	1132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	SAC7	P17121	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	NPR1	P22211	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	HEM3	P28789	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	DAK2	P43550	591 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	PRY1	P47032	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	BUD9	P53226	547 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	PMT7	Q06644	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	SKN7	P38889	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	SAP155	P43612	1002 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	MON1	P53129	644 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	DSE4	P53753	1117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	GAS5	Q08193	484 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	OXR1	Q08952	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	TAT1	P38085	619 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	POL32	P47110	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	YAF9	P53930	226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	AI3	P03877	415 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	SFA1	P32771	386 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	MGE1	P38523	228 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	ELG1	Q12050	791 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSE4	YKL049C	ATE1	P16639	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	ASF1	P32447	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	DAL4	Q04895	635 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	ERS1	P17261	260 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	TOS4	Q06266	489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	MCA1	Q08601	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	YIG1	Q08956	461 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSE4	YKL049C	RSC6	P25632	483 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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