RNA–Protein interactions for RNA: YJL103C

GSM1, Transcript of Putative zinc cluster protein of unknown function, yeast

Gene GSM1, Length 1,857 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GSM1	YJL103C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	HED1	Q03937	162 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	COG8	Q04632	607 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	ERV41	Q04651	352 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	NSE3	Q05541	303 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
GSM1	YJL103C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	RPC37	P36121	282 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	TIM54	P47045	478 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	ROM1	P53046	1155 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	HDA3	Q06623	655 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	HAP4	P14064	554 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	CMP2	P14747	604 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	OPY1	P38271	328 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	HXT5	P38695	592 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	ALD2	P47771	506 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	VTI1	Q04338	217 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	TSC13	Q99190	310 aa		5	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	MIP1	P15801	1254 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	KDX1	P36005	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	CTR9	P89105	1077 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	CDC45	Q08032	650 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	APC2	Q12440	853 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	FBP26	P32604	452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	MKS1	P34072	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	YBL086C	P38177	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	ISU1	Q03020	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	YRM1	Q12340	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	UBP1	P25037	809 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	MET32	Q12041	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	SWI6	P09959	803 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
GSM1	YJL103C	GRX7	P38068	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	RTT106	P40161	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	GAS4	Q08271	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	HMI1	Q12039	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	SGS1	P35187	1447 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	STE6	P12866	1290 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	DPB3	P27344	201 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	JJJ1	P53863	590 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GSM1	YJL103C	UGA3	P26370	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	NTH2	P35172	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	UBP12	P39538	1254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	TAP42	Q04372	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	DFG5	Q05031	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	NIP100	P33420	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	PAF1	P38351	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SMC3	P47037	1230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ARR1	Q06596	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SWI5	P08153	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	UTR2	P32623	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	FUI1	P38196	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	NDL1	Q06568	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	GRC3	Q07845	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	TRS33	Q99394	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	HMG1	P12683	1054 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	MER1	P16523	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ANP1	P32629	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	ESL2	P36168	1195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	MXR1	P40029	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	SDS3	P40505	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	PNG1	Q02890	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	CDC4	P07834	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GSM1	YJL103C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 132.6 ms