RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W BIO5P53744 561 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
VFA1YER128W TAF7Q05021 590 aa5.18□□□□□ -1.58
VFA1YER128W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
VFA1YER128W PUN1Q06991 263 aa5.18□□□□□ -1.58
VFA1YER128W SOG2Q08817 791 aa5.18□□□□□ -1.58
VFA1YER128W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
VFA1YER128W TFA2P36145 328 aa5.16□□□□□ -1.58
VFA1YER128W AIM46P38885 310 aa5.16□□□□□ -1.58
VFA1YER128W POL5P39985 1022 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
VFA1YER128W NCE103P53615 221 aa5.16□□□□□ -1.58
VFA1YER128W ALD3P54114 506 aa5.16□□□□□ -1.58
VFA1YER128W SPO71Q03868 1245 aa5.16□□□□□ -1.58
VFA1YER128W FUS1P11710 512 aa5.15□□□□□ -1.59
VFA1YER128W CPS1P27614 576 aa5.15□□□□□ -1.59
VFA1YER128W HXT8P40886 569 aa5.15□□□□□ -1.59
VFA1YER128W SRS2P12954 1174 aa5.14□□□□□ -1.59
VFA1YER128W ELG1Q12050 791 aa5.14□□□□□ -1.59
VFA1YER128W PUP1P25043 261 aa5.13□□□□□ -1.59
VFA1YER128W UBP5P39944 805 aa5.13□□□□□ -1.59
VFA1YER128W NEO1P40527 1151 aa5.13□□□□□ -1.59
VFA1YER128W RNQ1P25367 405 aa5.12□□□□□ -1.59
VFA1YER128W SDH1Q00711 640 aa5.12□□□□□ -1.59
VFA1YER128W GIC2Q06648 383 aa5.12□□□□□ -1.59
VFA1YER128W ERS1P17261 260 aa5.11□□□□□ -1.59
VFA1YER128W KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
VFA1YER128W RGD2P43556 714 aa5.1□□□□□ -1.59
VFA1YER128W BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
VFA1YER128W SEA4P38164 1038 aa5.09□□□□□ -1.59
VFA1YER128W NTA1P40354 457 aa5.09□□□□□ -1.59
VFA1YER128W YJR124CP47159 448 aa5.09□□□□□ -1.59
VFA1YER128W SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
VFA1YER128W YNR065CP53751 1116 aa5.09□□□□□ -1.59
VFA1YER128W RRN6P32786 894 aa5.08□□□□□ -1.6
VFA1YER128W SEG2P34250 1132 aa5.08□□□□□ -1.6
VFA1YER128W LRG1P35688 1017 aa5.08□□□□□ -1.6
VFA1YER128W POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
VFA1YER128W FAR11P53917 953 aa5.08□□□□□ -1.6
VFA1YER128W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
VFA1YER128W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
VFA1YER128W RAD55P38953 406 aa5.07□□□□□ -1.6
VFA1YER128W ECL1P48235 211 aa5.07□□□□□ -1.6
VFA1YER128W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VFA1YER128W NSI1Q12457 570 aa5.07□□□□□ -1.6
VFA1YER128W NIT1P40447 199 aa5.06□□□□□ -1.6
VFA1YER128W FET4P40988 552 aa5.06□□□□□ -1.6
VFA1YER128W MMM1P41800 426 aa5.06□□□□□ -1.6
VFA1YER128W YMR074CQ04773 145 aa5.06□□□□□ -1.6
VFA1YER128W HVG1P0CE11 249 aa5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W KTR2P33550 425 aa5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W PNP1Q05788 311 aa5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W YOR223WQ12015 292 aa5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W APC11Q12157 165 aa5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W GLO4Q12320 285 aa5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W DFG16Q99234 619 aa5.05□□□□□ -1.6
VFA1YER128W SMC1P32908 1225 aa5.04□□□□□ -1.6
VFA1YER128W IRS4P36115 615 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VFA1YER128W PSY2P40164 858 aa5.04□□□□□ -1.6
VFA1YER128W CIT3P43635 486 aa5.04□□□□□ -1.6
VFA1YER128W RPB10P22139 70 aa5.03□□□□□ -1.6
VFA1YER128W WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
VFA1YER128W LEO1P38439 464 aa5.03□□□□□ -1.6
VFA1YER128W PRP43P53131 767 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
VFA1YER128W YML083CQ04526 418 aa5.03□□□□□ -1.6
VFA1YER128W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
VFA1YER128W GPT2P36148 743 aa5.02□□□□□ -1.61
VFA1YER128W DMA2P53924 522 aa5.02□□□□□ -1.61
VFA1YER128W GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
VFA1YER128W YKL222CP35995 705 aa5.01□□□□□ -1.61
VFA1YER128W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
VFA1YER128W YLL054CQ12244 843 aa5.01□□□□□ -1.61
VFA1YER128W SSA4P22202 642 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
VFA1YER128W RCM1P53972 490 aa5□□□□□ -1.61
VFA1YER128W YHL008CP38750 627 aa4.99□□□□□ -1.61
VFA1YER128W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
VFA1YER128W LSO1Q3E827 93 aa4.99□□□□□ -1.61
VFA1YER128W FUR4P05316 633 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
VFA1YER128W YCR015CP25616 317 aa4.98□□□□□ -1.61
VFA1YER128W HSP78P33416 811 aa4.98□□□□□ -1.61
VFA1YER128W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
VFA1YER128W GCV1P48015 400 aa4.96□□□□□ -1.62
VFA1YER128W URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
VFA1YER128W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
VFA1YER128W ESC8Q08119 714 aa4.95□□□□□ -1.62
VFA1YER128W CDA2Q06703 312 aa4.94□□□□□ -1.62
VFA1YER128W YIG1Q08956 461 aa4.94□□□□□ -1.62
VFA1YER128W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VFA1YER128W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VFA1YER128W ADP1P25371 1049 aa4.93□□□□□ -1.62
VFA1YER128W ECM2P38241 364 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
VFA1YER128W CTR9P89105 1077 aa4.93□□□□□ -1.62
VFA1YER128W BOL3P39724 118 aa4.92□□□□□ -1.62
VFA1YER128W HTS1P07263 546 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
VFA1YER128W NPR1P22211 790 aa4.91□□□□□ -1.62
VFA1YER128W TSA1P34760 196 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
VFA1YER128W GIP4P39732 760 aa4.9□□□□□ -1.63
VFA1YER128W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
VFA1YER128W TAF1P46677 1066 aa4.9□□□□□ -1.63
VFA1YER128W ALT1P52893 592 aa4.9□□□□□ -1.63
VFA1YER128W MEC3Q02574 474 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms