RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT105	YER104W	TTI1	P36097	1038 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	PAN5	P38787	379 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	YJL181W	P46987	611 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	THI80	P35202	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	GAS4	Q08271	471 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	GAL2	P13181	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	LEM3	P42838	414 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	GIC2	Q06648	383 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTT105	YER104W	BSD2	P38356	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	PPT1	P53043	513 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	NSI1	Q12457	570 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	FLR1	P38124	548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	GIP1	P38229	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	GUP1	P53154	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	VMA3	P25515	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	HSP78	P33416	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	TGL4	P36165	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	VAN1	P23642	535 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	SLD2	P34252	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	DYS1	P38791	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	CWH41	P53008	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	ROM1	P53046	1155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	ECM23	Q02710	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	CAB1	Q04430	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	YIL165C	P40446	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	MRPL33	P20084	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	PUP1	P25043	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	MMM1	P41800	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	ELG1	Q12050	791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	TRS33	Q99394	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	YPT53	P36019	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	ISW1	P38144	1129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	YML083C	Q04526	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	SOG2	Q08817	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTT105	YER104W	LDH1	P38139	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	UBX7	P38349	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	CIT3	P43635	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	SUV3	P32580	737 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	TFA2	P36145	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	ERS1	P17261	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	NFS1	P25374	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	RCM1	P53972	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	ALD3	P54114	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	MSN1	P22148	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	HEM3	P28789	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTT105	YER104W	YBR197C	P38306	217 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	PUN1	Q06991	263 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	NEO1	P40527	1151 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	ORC3	P54790	616 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	FUS1	P11710	512 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	ADP1	P25371	1049 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	FAR11	P53917	953 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	HAT1	Q12341	374 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	SRS2	P12954	1174 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	ASF1	P32447	279 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	ISC10	P32645	267 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	RRN6	P32786	894 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	MET10	P39692	1035 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	RIM8	P53179	542 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	YBR287W	P38355	427 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	AIM46	P38885	310 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	YJR124C	P47159	448 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RTT105	YER104W	GPT2	P36148	743 aa		4.46	□□□□□ -1.7

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