RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.74■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 SLC20A2Q08357 652 aa21.73■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.73■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 KIF2CQ99661 725 aa21.73■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.72■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 NGEFQ8N5V2 710 aa21.72■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 LAMC1P11047 1609 aa21.72■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.71■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 RGS22Q8NE09 1264 aa21.71■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.71■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
GLIS1-202ENST00000628545 ASXL2Q76L83 1435 aa21.7■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.7■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.7■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 AK9Q5TCS8 1911 aa21.7■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.7■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 PREX2Q70Z35 1606 aa21.69■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 KCNJ4P48050 445 aa21.69■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.69■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.69■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 FAM177BA6PVY3 158 aa21.67■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 NEUROD2Q15784 382 aa21.67■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 A2MP01023 1474 aa21.65■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.65■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.64■■□□□ 1.06
GLIS1-202ENST00000628545 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.64■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 KIF3AQ9Y496 699 aa21.64■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 GPT2Q8TD30 523 aa21.63■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 SYCE3A1L190 88 aa21.62■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 RNF214Q8ND24 703 aa21.62■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.62■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.61■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.61■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 CERS3Q8IU89 383 aa21.61■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 KIF16BQ96L93 1317 aa21.61■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 NUCB2P80303 420 aa21.6■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.6■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.59■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 SYNMO15061 1565 aa21.59■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 PKP1Q13835 747 aa21.58■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 PLCH2O75038 1416 aa21.58■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.58■■□□□ 1.05
GLIS1-202ENST00000628545 LNPKQ9C0E8 428 aa21.58■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.57■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.57■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 MPNDQ8N594 471 aa21.56■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.56■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 FEZ1Q99689 392 aa21.56■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.55■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 SLFN14P0C7P3 912 aa21.54■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 NUCB1Q02818 461 aa21.54■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.54■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 TIGD1Q96MW7 591 aa21.54■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC66A2RUB6 948 aa21.53■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 ANKRD7Q92527 254 aa21.53■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 OGFRQ9NZT2 677 aa21.53■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 CAPN2P17655 700 aa21.53■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 TULP2O00295 520 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 CDCA8Q53HL2 280 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-202ENST00000628545 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 WDR63Q8IWG1 891 aa21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM27P14373 513 aa21.49■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 RUNDC1Q96C34 613 aa21.49■■□□□ 1.03
GLIS1-202ENST00000628545 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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