RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN15O75808 1086 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 APBA3O96018 575 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE3BQ13370 1112 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 SPON1Q9HCB6 807 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 POGKQ9P215 609 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT172Q9UG01 1749 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA3Q99758 1704 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM37O94972 964 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 NRAPQ86VF7 1730 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3C2GO75747 1445 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 EVA1CP58658 441 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM182BQ5T319 152 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAM1Q96QH2 718 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNQ2O43526 872 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 STRN4Q9NRL3 753 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 BARGINQ6ZT62 677 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 DLC1Q96QB1 1528 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 USP35Q9P2H5 1018 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 ALS2Q96Q42 1657 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0232Q92628 1395 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 RREB1Q92766 1687 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP7BP35670 1465 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNA2Q15822 529 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 PLSCR1O15162 318 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 SSH2Q76I76 1423 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 STAC3Q96MF2 364 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 ITSN1Q15811 1721 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP13Q86W25 1043 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 STK32BQ9NY57 414 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF8P60827 252 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 DDB1Q16531 1140 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ABTB2Q8N961 1025 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CPDO75976 1380 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IFFO2Q5TF58 517 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CRB1P82279 1406 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB7AO95365 584 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MTFR1LQ9H019 292 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT17Q9BSW7 474 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 GCP02774 474 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.7 ms