RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC01548A6NM66 108 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ALADP13716 330 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DUSP1P28562 367 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PROK1P58294 105 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MYCT1Q8N699 235 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCT6BQ92526 530 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAR2Q96K12 515 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RITA1Q96K30 269 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.3□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BCL9O00512 1426 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TISP43B9A030 160 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ACTL6BO94805 426 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRKCGP05129 697 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TFF2Q03403 129 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ANO1Q5XXA6 986 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GLMPQ8WWB7 406 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MAFFQ9ULX9 164 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TTC34A8MYJ7 566 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRRT4C9JH25 899 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM232C9JQI7 657 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 M0QZQ0 153 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NBNO60934 754 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GRK6P43250 576 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CNGA3Q16281 694 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRIM60Q495X7 471 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LIN54Q6MZP7 749 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ITSN1Q15811 1721 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PAPPAQ13219 1627 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AKAP12Q02952 1782 aa8.27□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GYS1P13807 737 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRELPP51888 382 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AP2B1P63010 937 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BTBD16Q32M84 506 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPATA5Q8NB90 893 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NPIPB3Q92617 1050 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PPCSQ9HAB8 311 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ACEP12821 1306 aa8.27□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ADCY9O60503 1353 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LARGE1O95461 756 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 THBS4P35443 961 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C16orf89Q6UX73 402 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RINLQ6ZS11 566 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KIF28PB7ZC32 967 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NKX2-8O15522 239 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PPP6R2O75170 966 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RNF8O76064 485 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms