RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ISXQ2M1V0 245 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TMC6Q7Z403 805 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf29Q8N999 325 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF34Q969K3 372 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT43Q96FT9 208 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM4Q9C037 500 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SATB2Q9UPW6 733 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HHLA1C9JL84 531 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IKBKBO14920 756 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FFAR2O15552 330 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KALRNO60229 2985 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBL1XO60907 577 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PLXNA2O75051 1894 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED1O96006 694 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCP20941 246 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKAP23743 735 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 GJB2P29033 226 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 AKT2P31751 481 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3CAP42336 1068 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NUCB2P80303 420 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 INCA1Q0VD86 236 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NUMA1Q14980 2115 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SCD5Q86SK9 330 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM69Q86WT6 500 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FIBINQ8TAL6 211 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC17Q96AE7 1141 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SGF29Q96ES7 293 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 APOLD1Q96LR9 279 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG5Q96R06 1193 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA3CQ99985 751 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 STRADBQ9C0K7 418 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 STARD5Q9NSY2 213 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HESX1Q9UBX0 185 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GVM2 712 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM38O00635 465 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SUV39H1O43463 412 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGA2BP08514 1039 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 THEGLP0DJG4 465 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF18P17022 549 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CSKP41240 450 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 OXCT1P55809 520 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN10P78369 228 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ECT2LQ008S8 904 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNMA1Q12791 1236 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC12A1Q13621 1099 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ12Q14500 433 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf17Q53FE4 359 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK5Q6P3R8 708 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf80Q86SX3 495 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI44Q8TCB0 444 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF516Q92618 1163 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NAT6Q93015 286 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 AZIN2Q96A70 460 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC114Q96M63 670 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SDCBP2Q9H190 292 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 EBF2Q9HAK2 575 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PREBQ9HCU5 417 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DYRK4Q9NR20 520 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.15□□□□□ -1.1
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