RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Paqr6Q6TCG5 343 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clec4b1Q7TS58 209 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc16Q80TN4 772 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr3eQ9CZT4 710 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhl41A2AUC9 606 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm1141B9EJU1 475 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DcxO88809 366 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adam15O88839 864 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tac1P41539 130 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fbp2P70695 339 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adamts1P97857 968 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plcl1Q3USB7 1096 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tyw3Q8BSA9 257 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scara3Q8C850 606 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ItchQ8C863 864 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhl2Q8JZP3 593 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pacsin3Q99JB8 424 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 StambpQ9CQ26 424 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tdp2Q9JJX7 370 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ern2Q9Z2E3 911 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa22.59■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr1160A2AVT0 319 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc175E9PVB3 822 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HcrtO55241 130 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sypl2O89104 264 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gata6Q61169 589 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf148Q61624 794 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CochQ62507 552 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pnma2Q8BHK0 365 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clptm1Q8VBZ3 664 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam114a2Q8VE88 497 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ecrg4Q99LS0 148 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arpc2Q9CVB6 300 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa22.58■■□□□ 1.21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il2P04351 169 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TxnP10639 105 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam91a1Q3UVG3 837 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpsm1Q6IR34 673 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb41Q811F1 908 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fra10ac1Q8BP78 315 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sorcs3Q8VI51 1219 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AslQ91YI0 464 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Akr1c12Q9JLI0 323 aa22.58■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fibcd1A2AV25 459 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptar1E9QAB6 424 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E230025N22RikG5E8S3 482 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B020004C17RikJ3QP07 232 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EsrraO08580 422 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alas2P08680 587 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp3a13Q64464 503 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubxn7Q6P5G6 467 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fastkd5Q7TMV3 762 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf168Q80XJ2 565 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bmt2Q8BXK4 403 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TdrpQ8C5P7 182 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnh1Q91VI7 456 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc30a1Q99J38 664 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim42Q9D2H5 723 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbck1Q9WUB0 508 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LipaQ9Z0M5 397 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ThadaA8C756 1938 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 XntrpcF8VQM8 1264 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7942L7N277 499 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klc2O88448 599 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FynP39688 537 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpr65Q61038 337 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf235Q61116 645 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf821Q6PD05 413 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Efr3bQ6ZQ18 817 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amer2Q8CCJ4 672 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mul1Q8VCM5 352 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vangl2Q91ZD4 521 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NamptQ99KQ4 491 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plin3Q9DBG5 437 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gdap2Q9DBL2 498 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cul3Q9JLV5 768 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem131O70472 1877 aa22.57■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col11a1Q61245 1804 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttll11A4Q9F4 727 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 UprtB1AVZ0 310 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ebf3O08791 596 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TnfP06804 235 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Proser1Q5PRE5 913 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdha6Q91Y14 946 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem86aQ9D8N3 241 aa22.56■■□□□ 1.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tsga13Q9DA17 273 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms