Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tyw3Q8BSA9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tyw3Q8BSA9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Tyw3Q8BSA9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tyw3Q8BSA9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tyw3Q8BSA9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tyw3Q8BSA9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Tyw3Q8BSA9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tyw3Q8BSA9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tyw3Q8BSA9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tyw3Q8BSA9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tyw3Q8BSA9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tyw3Q8BSA9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tyw3Q8BSA9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tyw3Q8BSA9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tyw3Q8BSA9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tyw3Q8BSA9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tyw3Q8BSA9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tyw3Q8BSA9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tyw3Q8BSA9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tyw3Q8BSA9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tyw3Q8BSA9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tyw3Q8BSA9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tyw3Q8BSA9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tyw3Q8BSA9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tyw3Q8BSA9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tyw3Q8BSA9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tyw3Q8BSA9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tyw3Q8BSA9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tyw3Q8BSA9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tyw3Q8BSA9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tyw3Q8BSA9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tyw3Q8BSA9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tyw3Q8BSA9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tyw3Q8BSA9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tyw3Q8BSA9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tyw3Q8BSA9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tyw3Q8BSA9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tyw3Q8BSA9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tyw3Q8BSA9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tyw3Q8BSA9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tyw3Q8BSA9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tyw3Q8BSA9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tyw3Q8BSA9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tyw3Q8BSA9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tyw3Q8BSA9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Tyw3Q8BSA9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tyw3Q8BSA9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tyw3Q8BSA9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tyw3Q8BSA9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tyw3Q8BSA9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tyw3Q8BSA9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tyw3Q8BSA9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tyw3Q8BSA9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tyw3Q8BSA9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tyw3Q8BSA9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tyw3Q8BSA9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tyw3Q8BSA9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tyw3Q8BSA9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tyw3Q8BSA9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tyw3Q8BSA9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tyw3Q8BSA9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tyw3Q8BSA9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tyw3Q8BSA9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tyw3Q8BSA9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tyw3Q8BSA9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tyw3Q8BSA9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tyw3Q8BSA9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tyw3Q8BSA9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tyw3Q8BSA9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tyw3Q8BSA9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tyw3Q8BSA9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tyw3Q8BSA9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tyw3Q8BSA9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tyw3Q8BSA9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tyw3Q8BSA9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tyw3Q8BSA9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tyw3Q8BSA9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tyw3Q8BSA9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tyw3Q8BSA9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tyw3Q8BSA9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tyw3Q8BSA9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tyw3Q8BSA9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tyw3Q8BSA9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tyw3Q8BSA9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tyw3Q8BSA9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tyw3Q8BSA9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tyw3Q8BSA9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tyw3Q8BSA9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tyw3Q8BSA9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tyw3Q8BSA9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tyw3Q8BSA9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tyw3Q8BSA9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tyw3Q8BSA9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tyw3Q8BSA9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tyw3Q8BSA9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tyw3Q8BSA9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tyw3Q8BSA9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tyw3Q8BSA9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tyw3Q8BSA9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms