Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI51

Sorcs3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs3Q8VI51 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Sorcs3Q8VI51 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sorcs3Q8VI51 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sorcs3Q8VI51 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sorcs3Q8VI51 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Sorcs3Q8VI51 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sorcs3Q8VI51 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sorcs3Q8VI51 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sorcs3Q8VI51 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sorcs3Q8VI51 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sorcs3Q8VI51 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sorcs3Q8VI51 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sorcs3Q8VI51 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sorcs3Q8VI51 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sorcs3Q8VI51 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sorcs3Q8VI51 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Sorcs3Q8VI51 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sorcs3Q8VI51 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sorcs3Q8VI51 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sorcs3Q8VI51 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sorcs3Q8VI51 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sorcs3Q8VI51 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sorcs3Q8VI51 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sorcs3Q8VI51 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sorcs3Q8VI51 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sorcs3Q8VI51 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Sorcs3Q8VI51 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sorcs3Q8VI51 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sorcs3Q8VI51 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sorcs3Q8VI51 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sorcs3Q8VI51 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sorcs3Q8VI51 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sorcs3Q8VI51 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sorcs3Q8VI51 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sorcs3Q8VI51 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sorcs3Q8VI51 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sorcs3Q8VI51 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sorcs3Q8VI51 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sorcs3Q8VI51 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sorcs3Q8VI51 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sorcs3Q8VI51 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sorcs3Q8VI51 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sorcs3Q8VI51 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sorcs3Q8VI51 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sorcs3Q8VI51 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sorcs3Q8VI51 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sorcs3Q8VI51 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sorcs3Q8VI51 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sorcs3Q8VI51 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sorcs3Q8VI51 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sorcs3Q8VI51 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sorcs3Q8VI51 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sorcs3Q8VI51 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sorcs3Q8VI51 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sorcs3Q8VI51 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sorcs3Q8VI51 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sorcs3Q8VI51 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sorcs3Q8VI51 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sorcs3Q8VI51 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sorcs3Q8VI51 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sorcs3Q8VI51 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sorcs3Q8VI51 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sorcs3Q8VI51 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sorcs3Q8VI51 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sorcs3Q8VI51 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sorcs3Q8VI51 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorcs3Q8VI51 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorcs3Q8VI51 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorcs3Q8VI51 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorcs3Q8VI51 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorcs3Q8VI51 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sorcs3Q8VI51 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sorcs3Q8VI51 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sorcs3Q8VI51 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sorcs3Q8VI51 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sorcs3Q8VI51 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sorcs3Q8VI51 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sorcs3Q8VI51 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sorcs3Q8VI51 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sorcs3Q8VI51 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sorcs3Q8VI51 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sorcs3Q8VI51 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sorcs3Q8VI51 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sorcs3Q8VI51 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sorcs3Q8VI51 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sorcs3Q8VI51 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sorcs3Q8VI51 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sorcs3Q8VI51 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sorcs3Q8VI51 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sorcs3Q8VI51 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sorcs3Q8VI51 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sorcs3Q8VI51 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sorcs3Q8VI51 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sorcs3Q8VI51 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sorcs3Q8VI51 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sorcs3Q8VI51 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sorcs3Q8VI51 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sorcs3Q8VI51 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sorcs3Q8VI51 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sorcs3Q8VI51 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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