Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
HcrtO55241 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
HcrtO55241 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
HcrtO55241 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
HcrtO55241 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
HcrtO55241 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
HcrtO55241 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
HcrtO55241 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,13■■■□□ 2,73
HcrtO55241 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
HcrtO55241 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
HcrtO55241 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,75■■■□□ 2,67
HcrtO55241 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
HcrtO55241 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,44■■■□□ 2,62
HcrtO55241 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
HcrtO55241 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
HcrtO55241 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
HcrtO55241 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
HcrtO55241 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
HcrtO55241 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
HcrtO55241 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
HcrtO55241 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
HcrtO55241 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
HcrtO55241 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
HcrtO55241 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
HcrtO55241 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
HcrtO55241 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
HcrtO55241 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
HcrtO55241 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
HcrtO55241 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
HcrtO55241 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
HcrtO55241 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
HcrtO55241 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
HcrtO55241 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
HcrtO55241 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
HcrtO55241 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,19■■■□□ 2,42
HcrtO55241 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
HcrtO55241 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
HcrtO55241 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
HcrtO55241 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,96■■■□□ 2,39
HcrtO55241 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
HcrtO55241 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
HcrtO55241 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
HcrtO55241 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
HcrtO55241 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
HcrtO55241 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
HcrtO55241 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
HcrtO55241 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
HcrtO55241 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
HcrtO55241 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
HcrtO55241 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
HcrtO55241 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
HcrtO55241 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
HcrtO55241 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
HcrtO55241 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
HcrtO55241 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
HcrtO55241 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
HcrtO55241 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
HcrtO55241 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
HcrtO55241 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
HcrtO55241 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
HcrtO55241 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
HcrtO55241 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
HcrtO55241 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
HcrtO55241 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
HcrtO55241 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
HcrtO55241 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
HcrtO55241 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
HcrtO55241 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
HcrtO55241 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,71■■■□□ 2,19
HcrtO55241 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
HcrtO55241 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
HcrtO55241 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
HcrtO55241 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
HcrtO55241 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
HcrtO55241 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
HcrtO55241 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,48■■■□□ 2,15
HcrtO55241 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
HcrtO55241 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
HcrtO55241 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
HcrtO55241 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
HcrtO55241 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
HcrtO55241 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
HcrtO55241 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
HcrtO55241 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
HcrtO55241 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
HcrtO55241 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
HcrtO55241 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
HcrtO55241 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
HcrtO55241 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
HcrtO55241 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
HcrtO55241 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
HcrtO55241 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
HcrtO55241 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
HcrtO55241 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
HcrtO55241 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
HcrtO55241 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
HcrtO55241 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
HcrtO55241 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
HcrtO55241 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
HcrtO55241 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
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