Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E3

Ern2, Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE2, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ern2Q9Z2E3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Ern2Q9Z2E3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ern2Q9Z2E3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ern2Q9Z2E3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ern2Q9Z2E3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ern2Q9Z2E3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ern2Q9Z2E3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Ern2Q9Z2E3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ern2Q9Z2E3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ern2Q9Z2E3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Ern2Q9Z2E3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ern2Q9Z2E3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ern2Q9Z2E3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ern2Q9Z2E3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ern2Q9Z2E3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ern2Q9Z2E3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ern2Q9Z2E3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ern2Q9Z2E3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ern2Q9Z2E3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ern2Q9Z2E3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ern2Q9Z2E3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ern2Q9Z2E3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ern2Q9Z2E3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ern2Q9Z2E3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ern2Q9Z2E3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ern2Q9Z2E3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ern2Q9Z2E3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ern2Q9Z2E3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ern2Q9Z2E3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ern2Q9Z2E3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ern2Q9Z2E3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ern2Q9Z2E3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ern2Q9Z2E3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ern2Q9Z2E3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ern2Q9Z2E3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ern2Q9Z2E3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ern2Q9Z2E3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ern2Q9Z2E3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ern2Q9Z2E3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ern2Q9Z2E3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ern2Q9Z2E3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ern2Q9Z2E3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ern2Q9Z2E3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ern2Q9Z2E3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ern2Q9Z2E3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ern2Q9Z2E3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ern2Q9Z2E3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ern2Q9Z2E3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ern2Q9Z2E3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ern2Q9Z2E3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ern2Q9Z2E3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ern2Q9Z2E3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ern2Q9Z2E3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ern2Q9Z2E3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ern2Q9Z2E3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ern2Q9Z2E3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ern2Q9Z2E3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ern2Q9Z2E3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ern2Q9Z2E3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ern2Q9Z2E3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ern2Q9Z2E3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ern2Q9Z2E3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ern2Q9Z2E3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ern2Q9Z2E3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ern2Q9Z2E3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ern2Q9Z2E3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ern2Q9Z2E3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ern2Q9Z2E3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ern2Q9Z2E3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ern2Q9Z2E3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ern2Q9Z2E3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ern2Q9Z2E3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ern2Q9Z2E3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ern2Q9Z2E3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ern2Q9Z2E3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ern2Q9Z2E3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ern2Q9Z2E3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ern2Q9Z2E3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ern2Q9Z2E3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ern2Q9Z2E3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ern2Q9Z2E3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ern2Q9Z2E3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ern2Q9Z2E3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ern2Q9Z2E3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ern2Q9Z2E3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ern2Q9Z2E3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ern2Q9Z2E3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ern2Q9Z2E3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ern2Q9Z2E3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ern2Q9Z2E3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ern2Q9Z2E3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ern2Q9Z2E3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ern2Q9Z2E3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ern2Q9Z2E3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ern2Q9Z2E3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ern2Q9Z2E3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ern2Q9Z2E3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ern2Q9Z2E3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ern2Q9Z2E3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ern2Q9Z2E3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms