RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261917.3

HCN4-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN4, Length 7,228 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4-201ENST00000261917 SLC26A4O43511 780 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 AGKQ53H12 422 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 LRRN4Q8WUT4 740 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PRKAB1Q9Y478 270 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SEC22BO75396 215 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 IGSF6O95976 241 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 VGLL4Q14135 290 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 MOB2Q70IA6 237 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 GAD1Q99259 594 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 KRT33AO76009 404 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 MIIPQ5JXC2 388 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 HDHD2Q9H0R4 259 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 LSP1P33241 339 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PARGQ86W56 976 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SGSM3Q96HU1 749 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TK2O00142 265 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 CHRNB3Q05901 458 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PDPK2PQ6A1A2 396 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ARHGEF19Q8IW93 802 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 RGS18Q9NS28 235 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PHACTR1Q9C0D0 580 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 HES2Q9Y543 173 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 FAM86B1E9PN63 330 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 OR56A5P0C7T3 313 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PTPN3P26045 913 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 HNF4AP41235 474 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PPATQ06203 517 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 MPP3Q13368 585 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 Q4G0T1 1027 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 HELQQ8TDG4 1101 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ISCUQ9H1K1 167 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PLPP4Q5VZY2 271 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 AQP5P55064 265 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 CDK20Q8IZL9 346 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 USP12O75317 370 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PFKPQ01813 784 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ATP8B4Q8TF62 1192 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SIK3Q9Y2K2 1263 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 DIP2AQ14689 1571 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ZW10O43264 779 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ATAD3BQ5T9A4 648 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 AGBL2Q5U5Z8 902 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 CEP68Q76N32 757 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 HEATR4Q86WZ0 1026 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 DNERQ8NFT8 737 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TIMM44O43615 452 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TLL1O43897 1013 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SERPINF2P08697 491 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SEMA3FQ13275 785 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 RCN1Q15293 331 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 CNPY3Q9BT09 278 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 IL25Q9H293 177 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 FAM50BQ9Y247 325 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TBL1XO60907 577 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 IL1BP01584 269 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 OR10G6Q8NH81 332 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 VTA1Q9NP79 307 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ACSL4O60488 711 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 OR6A2O95222 327 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PAFAH2Q99487 392 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 GAKO14976 1311 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 BTN3A1O00481 513 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 SCNN1GP51170 649 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 PTPAQ15257 358 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 TRIM66O15016 1216 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN4-201ENST00000261917 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms